SDHB突变驱动的转移性嗜铬细胞瘤和副神经节瘤的表观遗传与代谢重编程（DNA甲基化数据）
该数据集来自 omicsdi.org，收录了 34 例嗜铬细胞瘤和副神经节瘤（PPGLs）的 DNA 甲基化数据，用于研究 SDHB 突变状态与转移如何影响肿瘤的表观遗传景观
基本信息
资源简介
SDHB突变驱动的转移性嗜铬细胞瘤和副神经节瘤的表观遗传与代谢重编程（DNA甲基化数据）
该数据集来自 omicsdi.org，聚焦于由 SDHB 突变驱动的转移性嗜铬细胞瘤和副神经节瘤（PPGLs）的表观遗传与代谢重编程，具体内容为 DNA 甲基化数据。研究背景在于，携带 SDHB 突变的 PPGLs 患者具有明确的转移倾向，但其侵袭性行为背后的分子机制尚未被完全理解。该数据集收录了研究中分析的 34 例 PPGLs 的 DNA 甲基化数据，旨在探讨转移状态与 SDHB 突变状态如何共同塑造 PPGLs 的表观遗传景观，并区分二者对肿瘤进展的独立效应与联合效应。数据集在站内归类于肿瘤 / 脑肿瘤，主题标签为 Transcriptomics。
【数据集背景】
嗜铬细胞瘤和副神经节瘤（PPGLs）是起源于神经嵴相关嗜铬细胞的肿瘤。在临床观察中，发生于 SDHB 突变患者的 PPGLs 具有较为明确的转移倾向，然而这种侵袭性行为背后的分子机制仍未被充分理解。为深入探究这一问题，相关研究关注转移与 SDHB 突变状态如何影响 PPGLs 的表观遗传景观，试图厘清二者对肿瘤进展的独立作用与联合作用。该数据集正是这一研究背景下产生的 DNA 甲基化数据集合，来源于 omicsdi.org，站内分类为肿瘤 / 脑肿瘤。
【数据内容】
该数据集包含 34 例 PPGLs 的 DNA 甲基化数据。这些样本来自上述研究中所分析的全部 PPGLs 病例。数据集的核心内容围绕 DNA 甲基化展开，用于支撑对 SDHB 突变状态与转移如何影响肿瘤表观遗传景观的研究。主题标签为 Transcriptomics。除上述信息外，源站未提供关于甲基化检测平台、探针数量、甲基化位点覆盖范围、数据文件格式或样本分组明细等更具体的内容。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述指出，研究调查了转移和 SDHB 突变状态如何影响 PPGLs 的表观遗传景观，并收录了该研究中分析的 34 例 PPGLs 的 DNA 甲基化数据。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、患者人群特征以及具体的实验操作流程，源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息，该数据集适用于研究与 SDHB 突变相关的转移性嗜铬细胞瘤和副神经节瘤的表观遗传特征，尤其是 DNA 甲基化层面的变化。它可用于探索转移状态与 SDHB 突变状态对 PPGLs 表观遗传景观的独立影响和联合影响，也可为理解该疾病侵袭性行为的分子机制提供甲基化数据支持。此外，由于主题标签为 Transcriptomics，该数据集可能在与转录组学相关的分析场景中被引用或整合。关于更具体的适用分析类型、可支持的统计模型或可回答的具体科学问题，源站未提供。
【使用方法】
源站未提供关于数据下载方式、文件组织格式、预处理步骤、标准化方法或推荐分析流程的具体说明。因此，无法依据现有信息给出该数据集的具体使用操作指引。
【质量与限制】
该数据集仅包含 34 例 PPGLs 的 DNA 甲基化数据，样本量相对有限。源站未提供关于数据质量评估、缺失值情况、批次效应控制、技术重复或验证实验的信息。此外，关于该数据集是否经过同行评审、是否有配套的临床注释或随访数据，源站未提供。使用者在解释结果时需考虑样本量及潜在混杂因素，但具体限制条件需以源站或原始研究为准。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式、许可协议、使用条款或数据访问限制等信息。如需引用或使用，应查阅 omicsdi.org 上该数据集的原始页面或相关发表文献以获取正式说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-15178
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
发生于SDHB突变患者的嗜铬细胞瘤和副神经节瘤（PPGLs）具有明确的转移倾向，但这种侵袭性行为背后的分子机制仍未完全阐明。我们研究了转移和SDHB突变状态如何影响PPGLs的表观遗传景观，旨在阐明它们对肿瘤进展的独立效应和联合效应。该数据集包含本研究中分析的34例PPGLs的DNA甲基化数据。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
