癌症研究所弥漫性内生性脑桥胶质瘤外显子组测序样本数据集
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/脑肿瘤分类,主题标签为 Genomics。数据为同一患者(SU-DIPG-XIII)的弥漫性内生性脑桥胶质瘤(DIPG)细胞全外显子组测序样本,细胞分别分离自脑桥和额叶内的脑室下区播散位点

基本信息
资源简介
癌症研究所弥漫性内生性脑桥胶质瘤外显子组测序样本数据集
该数据集收录于 omicsdi.org,属于肿瘤 / 脑肿瘤分类,主题标签为 Genomics。其内容为弥漫性内生性脑桥胶质瘤(DIPG)细胞的全外显子组测序样本,这些细胞来自同一患者(SU-DIPG-XIII),分别分离自脑桥以及额叶内的脑室下区播散位点。数据集名称中包含“INSTITUTE OF CANCER RESEARCH”及日期时间标识,并以“samples”作为样本层面的标识。整体而言,该数据集围绕同一患者原发部位与播散部位肿瘤细胞的基因组特征展开,属于肿瘤基因组学中针对脑肿瘤的测序样本资源,可用于关注 DIPG 空间异质性或播散机制的研究场景。
【数据集背景】
弥漫性内生性脑桥胶质瘤(DIPG)是一种发生在脑桥区域的肿瘤。该数据集所涉及的样本来自同一患者 SU-DIPG-XIII,关注的是从脑桥和额叶内的脑室下区播散位点分离得到的 DIPG 细胞。数据集被归类为肿瘤 / 脑肿瘤,主题标签为 Genomics,来源站为 omicsdi.org。其背景指向对同一患者不同解剖位置肿瘤细胞进行全外显子组测序,以支持对 DIPG 细胞在原发性部位与播散部位之间基因组特征的研究。
【数据内容】
该数据集的核心内容是全外显子组测序样本。具体而言,是对弥漫性内生性脑桥胶质瘤(DIPG)细胞进行全外显子组测序,这些细胞分别分离自脑桥和额叶内的脑室下区播散位点,且来自同一患者 SU-DIPG-XIII。数据集名称中包含“samples”字样,表明其以样本为组织单位。主题标签为 Genomics,分类为肿瘤 / 脑肿瘤。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、测序深度、覆盖度、变异列表或具体数据文件格式的进一步说明。
【采集与来源】
数据来源站为 omicsdi.org。样本来源为同一患者 SU-DIPG-XIII 的 DIPG 细胞,分别采集自脑桥和额叶内的脑室下区播散位点。数据集名称中包含“INSTITUTE OF CANCER RESEARCH”以及日期时间信息“14-08-2017-09:54:45:886”。除这些来源与采集部位信息外,源站未提供关于采集时间、采集机构、伦理审批或样本处理流程的更多细节。
【适用场景】
基于其分类与主题标签,该数据集适用于肿瘤 / 脑肿瘤相关研究,尤其是弥漫性内生性脑桥胶质瘤的基因组学分析。由于样本来自同一患者的脑桥原发部位与额叶内脑室下区播散位点,该数据集可用于关注 DIPG 细胞在原发与播散部位之间全外显子组层面差异的研究场景。主题标签 Genomics 表明其适用于基因组学相关分析。除上述方向外,源站未提供关于具体适用分析类型、疾病模型或临床转化场景的进一步说明。
【使用方法】
该数据集以样本形式提供,名称中包含“samples”。使用者可依据 omicsdi.org 来源站获取该数据集,并围绕全外显子组测序样本开展分析。由于涉及同一患者 SU-DIPG-XIII 的脑桥与额叶内脑室下区播散位点样本,使用时可考虑对这两个部位的测序样本进行比较或联合分析。除上述信息外,源站未提供关于数据下载方式、文件格式、处理流程、分析工具或参考基因组的进一步说明。
【质量与限制】
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤 / 脑肿瘤分类,主题标签为 Genomics。其样本为同一患者 SU-DIPG-XIII 的 DIPG 细胞全外显子组测序样本,分别来自脑桥和额叶内的脑室下区播散位点。除这些信息外,源站未提供关于数据质量评估、测序质量指标、样本量、批次效应、覆盖度或验证结果的说明。因此,关于该数据集的质量与限制,源站未提供进一步内容。
【引用与许可】
该数据集来源站为 omicsdi.org,数据集名称中包含“INSTITUTE OF CANCER RESEARCH”及日期时间标识。除上述信息外,源站未提供关于引用方式、许可协议、使用限制或版权归属的进一步说明。
下载信息
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暂未开放公开下载
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001003563
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
同一患者(SU-DIPG-XIII)脑桥及额叶室下区播散灶分离的弥漫性内生性脑桥胶质瘤(DIPG)细胞的全外显子组测序
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