ErasmusMC 胶质母细胞瘤原发与复发配对 RNA-seq 样本集
该数据集来自 omicsdi.org，收录 ErasmusMC 的胶质母细胞瘤 RNA-seq 样本，以原发与复发配对样本为主，并与早期一项 DNA 测序研究相匹配
基本信息
资源简介
ErasmusMC 胶质母细胞瘤原发与复发配对 RNA-seq 样本集
ena-DATASET-ErasmusMC-13-07-2021-14:23:08:540-67 - samples 是一个以胶质母细胞瘤为对象的 RNA-seq 样本数据集，归类于肿瘤 / 脑肿瘤方向，来源于 omicsdi.org。该数据集的核心价值在于其样本的组织方式：以原发与复发胶质母细胞瘤的配对样本为主，并且这些样本与早期开展的一项 DNA 测序研究相匹配。主题标签为 Genomics，说明其内容侧重基因组学层面的测序数据。整体而言，该数据集为研究胶质母细胞瘤在原发与复发阶段的转录组差异提供了成对的样本基础，适合围绕肿瘤复发机制、配对样本比较分析等方向开展探索性工作。
【数据集背景】
胶质母细胞瘤是脑肿瘤中备受关注的研究对象，其复发过程涉及复杂的分子层面变化。该数据集来自 ErasmusMC，聚焦于胶质母细胞瘤的 RNA-seq 样本，并以原发与复发配对的形式组织样本。这种配对设计使得同一患者的原发肿瘤与复发肿瘤可以在转录组层面进行对照，从而为理解肿瘤在复发过程中的表达变化提供样本支撑。数据集同时与早期一项 DNA 测序研究相匹配，意味着这些样本还可以与已有的 DNA 层面研究结果建立对应关系，形成多组学视角下的研究素材。主题标签 Genomics 进一步表明该数据集归属于基因组学范畴。
【数据内容】
该数据集收录的是胶质母细胞瘤的 RNA-seq 样本，且以原发与复发配对样本为主。样本类型为 RNA-seq，即转录组测序数据，关注的是基因表达层面的信息。配对结构是该数据集内容组织的关键特征：原发样本与复发样本成对出现，便于开展同一患者不同疾病阶段的比较。此外，这些样本与早期一项 DNA 测序研究相匹配，说明样本层面存在与 DNA 测序研究的对应关系。关于样本的具体数量、测序平台、读长、表达定量文件格式等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org，由 ErasmusMC 相关研究产生，数据集名称中包含 ErasmusMC 标识以及日期时间信息。样本采集的具体时间跨度、采集地点细节、伦理审批信息、样本纳入与排除标准等，源站未提供。数据集的来源站为 omicsdi.org，本站将其归类于肿瘤 / 脑肿瘤方向。
【适用场景】
基于原发与复发配对样本的结构，该数据集适用于胶质母细胞瘤复发相关的转录组比较研究，例如比较同一患者原发与复发阶段的基因表达差异、探索复发相关表达特征等。由于样本与早期 DNA 测序研究相匹配，也可用于将 RNA-seq 层面的发现与 DNA 测序研究结果进行对照分析，支持多组学整合探索。此外，该数据集可作为胶质母细胞瘤配对样本分析方法开发与验证的样本资源。需要说明的是，上述适用方向基于数据集的样本组织特征，具体分析可行性需结合数据实际内容判断；关于数据的具体分析用途说明，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以样本集合的形式提供，使用时应以原发与复发配对关系为组织线索开展分析，注意保持配对样本的对应性，避免将配对结构打散而损失设计信息。在与早期 DNA 测序研究结果联合使用时，需依据样本匹配关系进行对应。关于数据下载方式、文件格式、预处理流程、配套分析工具等具体使用说明，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集以配对样本为主，并非全部样本均为配对，使用时需确认具体样本的配对情况。数据集与早期 DNA 测序研究相匹配，但匹配的具体范围与程度，源站未提供。关于样本质量评估、测序深度、数据完整性、批次效应等技术质量指标，源站未提供。样本量、人群背景、肿瘤分级与分子分型等临床与生物学注释信息，源站未提供。使用时应结合源站信息进一步核实数据适用范围。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、文献出处、许可协议与使用条款，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前，应前往 omicsdi.org 相应页面核实相关要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001007860
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Collection of mostly matching primary and recurrent glioblastoma RNA-seq sample pairs, also matching with an earlier DNA sequencing study
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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