ENA CeMM 样本数据集
该数据集来源于 omicsdi.org，属于肿瘤/脑肿瘤领域，包含 150 例胶质母细胞瘤肿瘤样本的 RRBS 全基因组 DNA 甲基化谱
基本信息
资源简介
ENA CeMM 样本数据集
该数据集来源于 omicsdi.org，属于肿瘤/脑肿瘤领域，包含 150 例胶质母细胞瘤肿瘤样本的 RRBS 全基因组 DNA 甲基化谱。样本依据 Austrian Brain Tumor Registry 选取以代表一般胶质母细胞瘤患者群体，用于胶质母细胞瘤进展研究（GBMatch）的验证，其中 106 例来自 FFPE 样本、44 例来自新鲜冷冻样本；44 例新鲜冷冻样本还配套产生了 WGS 数据（43 个基因组）和 RNA-seq 数据（37 个转录组）。可用于脑肿瘤分子分型、甲基化特征分析与进展相关研究（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：通过 RRBS 对 150 例胶质母细胞瘤肿瘤样本进行全基因组 DNA 甲基化水平分析。患者依据 Austrian Brain Tumor Registry 选取，以代表胶质母细胞瘤患者的一般人群。这些 DNA 甲基化谱是为验证胶质母细胞瘤进展研究（GBMatch）而创建，包含 106 例来自 FFPE 样本的谱和 44 例来自新鲜冷冻样本的谱。对于这 44 例新鲜冷冻样本，还产生了 WGS 数据（43 个基因组）和 RNA-seq 数据（37 个转录组）用于验证目的。
【主题与分类】
主题标签：Genomics。本站分类：肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001004074
下载信息
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数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001004074
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
通过RRBS对150个胶质母细胞瘤样本进行全基因组DNA甲基化水平分析。患者依据奥地利脑肿瘤登记处数据选取，以代表胶质母细胞瘤患者的一般群体。这些DNA甲基化谱是为了验证胶质母细胞瘤进展研究(GBMatch)而创建的，包括来自FFPE样本的106个谱和来自新鲜冷冻样本的44个谱。对于这44个新鲜冷冻样本，还产生了全基因组测序数据(43个基因组)和RNA测序数据(37个转录组)，用于验证目的。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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