ena-DATASET-BTRC-26-04-2017-20:29:35:774-41 - samples 数据集

该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤 / 脑肿瘤分类,主题标签为 Genomics。源站描述指出,弥漫性内生性脑桥胶质瘤(DIPG)是一种发生在儿童脑干的致命脑癌,目前没有有效治疗方法

omicsdi
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基因组分类Genomics
ena-DATASET-BTRC-26-04-2017-20:29:35:774-41 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

ena-DATASET-BTRC-26-04-2017-20:29:35:774-41 - samples 数据集

ena-DATASET-BTRC-26-04-2017-20:29:35:774-41 - samples 是一个以肿瘤、特别是脑肿瘤为分类方向的数据集,来源站为 omicsdi.org,主题标签为 Genomics。该数据集围绕弥漫性内生性脑桥胶质瘤(Diffuse Intrinsic Pontine Glioma,DIPG)展开。根据源站描述,DIPG 是一种发生在儿童脑干的致命脑癌,目前尚无有效治疗方法。为理解驱动 DIPG 发生发展的因素,相关研究整合了全基因组测序与甲基化、表达和拷贝数谱分析。该数据集作为这一研究背景下的样本集合,面向基因组学分析场景,可用于支持对 DIPG 分子特征的研究与探索。整体来看,该数据集的核心价值在于将 DIPG 这一罕见且致命的儿童脑肿瘤与多层次的基因组学数据联系起来,为后续分析提供样本层面的基础。

【数据集背景】

该数据集所属分类为肿瘤 / 脑肿瘤,聚焦于弥漫性内生性脑桥胶质瘤(DIPG)。源站描述指出,DIPG 是一种发生在儿童脑干的致命脑癌,目前没有有效治疗方法。由于缺乏有效治疗手段,理解其发生和进展的驱动因素成为相关研究的重要目标。该数据集正是在这一背景下产生,旨在为解析 DIPG 的分子机制提供数据支持。其主题标签为 Genomics,表明数据集与基因组学分析密切相关。

【数据内容】

根据源站描述,该数据集所对应的研究整合了全基因组测序(whole-genome-sequencing)与甲基化(methylation)、表达(expression)和拷贝数(copy-number)谱分析。数据集名称中包含“samples”字样,表明其内容与样本相关。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、具体字段、文件格式或数据规模的更多细节。

【采集与来源】

该数据集来源站为 omicsdi.org。数据集英文名称为 ena-DATASET-BTRC-26-04-2017-20:29:35:774-41 - samples。除来源站和名称外,源站未提供关于采集地点、采集时间、采集流程或样本处理方式的更多信息。

【适用场景】

基于其分类和主题标签,该数据集适用于肿瘤 / 脑肿瘤方向,尤其是与弥漫性内生性脑桥胶质瘤相关的基因组学研究场景。由于源站描述提到整合了全基因组测序与甲基化、表达和拷贝数谱分析,该数据集可用于支持对 DIPG 分子特征的分析与探索。除上述方向外,源站未提供关于具体适用场景的更多说明。

【使用方法】

源站未提供关于该数据集具体使用方法的说明,包括数据下载方式、预处理步骤、分析流程或配套工具等信息。

【质量与限制】

源站未提供关于该数据集质量评估、数据完整性、覆盖度或使用限制的说明。已知信息仅包括其分类、来源、主题标签以及源站描述中提及的研究整合内容。

【引用与许可】

源站未提供关于该数据集的引用方式或许可条款信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001003305

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

弥漫性内生性脑桥胶质瘤(DIPG)是一种致命的脑癌,起源于儿童脑干,目前尚无有效治疗方法。为了解DIPG的驱动因素,我们将全基因组测序与甲基化、表达和拷贝数分析相结合。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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