H3K27M突变型弥漫性内生性脑桥胶质瘤与正常脑组织样本数据集
该数据集来自omicsdi.org，包含H3K27M突变型弥漫性内生性脑桥胶质瘤（DIPG）与正常脑组织的配对样本，涵盖全外显子组测序（WES）和RNA测序（RNA-Seq）两类数据
基本信息
资源简介
H3K27M突变型弥漫性内生性脑桥胶质瘤与正常脑组织样本数据集
该数据集收录于omicsdi.org，主题标签为基因组学（Genomics），本站分类归入肿瘤领域的脑肿瘤方向。数据集英文名称为 e1a3a1fa-a9c3-4197-9611-05e6e911d24a - samples。根据源站描述，该数据集围绕H3K27M突变型弥漫性内生性脑桥胶质瘤（DIPG）与正常脑组织展开，采用全外显子组测序（WES）和RNA测序（RNA-Seq）两种技术路线进行表征。其中WES覆盖21例DIPG样本和8例正常脑样本，RNA-Seq覆盖26例DIPG样本和12例正常脑样本。整体来看，该数据集提供了DIPG肿瘤组织与正常脑组织在基因组和转录组层面的配对样本资源，可用于探索H3K27M突变型DIPG的分子特征。
【数据集背景】
弥漫性内生性脑桥胶质瘤（DIPG）是一种发生于脑桥区域的脑肿瘤，本站分类将其归入肿瘤/脑肿瘤方向。该数据集聚焦于H3K27M突变型DIPG，并将其与正常脑组织进行对照研究。源站描述指出，研究目的是对H3K27M突变型DIPG和正常脑进行表征。主题标签为基因组学，说明该数据集的核心数据属于基因组学范畴。关于该数据集的更详细研究背景、所属项目、资助信息等，源站未提供。
【数据内容】
该数据集包含两类测序数据。第一类为全外显子组测序（WES），样本包括21例DIPG和8例正常脑。第二类为RNA测序（RNA-Seq），样本包括26例DIPG和12例正常脑。数据覆盖H3K27M突变型DIPG与正常脑组织，属于肿瘤与正常对照的配对样本设计。数据集英文名称中的“samples”提示其内容以样本为单位组织。关于具体的基因突变列表、表达矩阵、原始测序读长、数据文件格式、样本编号、临床信息等，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源站为omicsdi.org。源站描述仅说明使用WES和RNA-Seq对H3K27M突变型DIPG及正常脑进行表征，并给出了相应的样本数量。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、测序平台、测序深度、建库方法等，源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息，该数据集适用于与H3K27M突变型DIPG相关的基因组学和转录组学研究场景。具体而言，WES数据可用于考察DIPG样本的外显子组变异特征，RNA-Seq数据可用于考察DIPG样本的转录组特征，正常脑样本可作为对照。该数据集也可用于脑肿瘤分子机制探索、肿瘤与正常组织差异分析等方向。关于是否适用于临床诊断、预后预测、药物靶点筛选等具体应用，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以样本形式组织，用户可根据研究目的分别使用WES数据或RNA-Seq数据，也可将两类数据结合分析。使用时可将DIPG样本与正常脑样本进行对比。关于数据下载方式、访问链接、文件目录结构、分析流程、软件工具推荐等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的样本数量在源站描述中有明确说明：WES为21例DIPG和8例正常脑，RNA-Seq为26例DIPG和12例正常脑。关于数据质量评分、测序质量、批次效应、样本纳入排除标准、数据完整性、是否存在缺失值等，源站未提供。该数据集仅涉及H3K27M突变型DIPG，未说明是否包含其他分子亚型。使用时应结合源站描述和自身研究目的判断适用性。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、文献出处、DOI、许可协议、使用条款、数据共享政策等，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001006450
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
We characterised H3K27M-mutant diffuse intrinsic pontine glioma (DIPG) and normal brain using WES (n=21 DIPG, 8 normal brain) and RNA-Seq (n=26 DIPG, 12 normal brain)
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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