Dual IRE1 RNase 功能决定胶质母细胞瘤发展

该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤 / 脑肿瘤分类下的转录组学数据。其源站描述指出,该转录组数据集用于在 117 例 GBM 患者队列中验证在 U87 细胞系中鉴定出的 IRE1 依赖性基因表达特征

omicsdi
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时间序列分类Transcriptomics
Dual IRE1 RNase functions dictate glioblastoma development

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

Dual IRE1 RNase 功能决定胶质母细胞瘤发展

Dual IRE1 RNase functions dictate glioblastoma development 是一个聚焦于胶质母细胞瘤(GBM)的转录组学数据集,归属于肿瘤 / 脑肿瘤分类,来源站为 omicsdi.org。该数据集的核心价值在于为 IRE1 依赖性基因表达特征提供患者层面的验证依据:相关转录组数据被用于在一个由 117 例 GBM 患者组成的队列中,验证此前在 U87 细胞系中鉴定出的 IRE1 依赖性基因表达特征。围绕这一目标,数据集将细胞系层面的机制发现与患者队列层面的表达证据相衔接,主题标签为 Transcriptomics,适合关注脑肿瘤分子机制、内质网应激信号通路以及转录组验证研究的研究者参考使用。

【数据集背景】

胶质母细胞瘤是中枢神经系统中具有高度侵袭性的肿瘤类型,其发生发展涉及复杂的细胞内信号网络。IRE1 作为一种与内质网应激相关的 RNase,其双重功能被认为在肿瘤进程中发挥重要作用。该数据集所对应的研究语境,正是围绕 IRE1 RNase 功能如何影响胶质母细胞瘤发展这一问题展开。源站描述表明,研究者在 U87 细胞系中鉴定出一组依赖 IRE1 的基因表达特征,随后需要在更接近临床的患者样本中检验该特征是否成立。因此,该数据集承担的是从细胞系发现走向患者队列验证的关键环节,其背景指向 IRE1 相关转录调控与 GBM 发展之间的关联。

【数据内容】

该数据集属于转录组学数据,主题标签为 Transcriptomics。其内容围绕 IRE1 依赖性基因表达特征展开,用于在 GBM 患者队列中进行验证。源站描述明确指出,该转录组数据集被用于在 117 例 GBM 患者队列中验证在 U87 细胞系中鉴定出的 IRE1 依赖性基因表达特征。由此可知,数据集的核心内容与基因表达谱相关,并服务于特定表达特征的验证目的。除上述信息外,关于具体样本类型、测序平台、基因数量、表达矩阵结构、是否包含对照组或临床注释等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 omicsdi.org,属于肿瘤 / 脑肿瘤分类下的转录组学数据。源站描述提到其用于在 GBM 患者队列中开展验证,该队列规模为 117 例。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、患者纳入与排除标准、样本处理流程、测序或检测平台、数据生成机构等具体采集信息,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于在 GBM 患者队列层面验证 IRE1 依赖性基因表达特征的研究场景,也可用于与 U87 细胞系中鉴定出的表达特征进行对照分析。对于关注胶质母细胞瘤转录组学、IRE1 RNase 功能与肿瘤发展关系的研究者,该数据集可作为患者层面验证的证据来源。此外,在脑肿瘤分子机制研究中,若需要考察特定信号通路相关基因表达特征在临床队列中的表现,该数据集亦具备参考价值。关于其他具体应用场景,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件格式、分析流程、标准化处理步骤、代码或工具推荐等。使用者如需了解如何访问与处理该数据,应参考来源站 omicsdi.org 的相关说明。

【质量与限制】

该数据集的一个明确特征是包含 117 例 GBM 患者队列,用于验证 U87 细胞系中鉴定出的 IRE1 依赖性基因表达特征。关于数据质量指标、缺失值情况、批次效应、样本异质性、验证结果的统计显著性、假阳性控制等质量相关信息,源站未提供。其限制方面,现有信息仅表明该数据集用于验证特定表达特征,是否适用于其他研究目的、是否覆盖其他肿瘤类型或细胞系,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者在使用该数据集时,应自行查阅来源站 omicsdi.org 以获取相应的引用规范与许可条款。

下载信息

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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-6326

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

转录组数据集已用于在GBM患者队列(n=117)中验证在U87细胞系中鉴定出的IRE1依赖性基因表达特征。

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