胶质母细胞瘤DNA甲基化谱：对基因表达与临床结局的影响
该数据集来自 omicsdi.org，为胶质母细胞瘤 DNA 甲基化谱研究，主题标签为 Transcriptomics，本站归类为肿瘤/脑肿瘤
基本信息
资源简介
胶质母细胞瘤DNA甲基化谱：对基因表达与临床结局的影响
DNA Methylation Profiling of Glioblastoma: Impact on Gene Expression and Clinical Outcome 是一个聚焦胶质母细胞瘤 DNA 甲基化谱的研究型数据集，主题标签为 Transcriptomics，在分类上归属于肿瘤 / 脑肿瘤方向，来源站为 omicsdi.org。从源站描述可知，该数据集是一个 SuperSeries，由两个子系列组成：GSE22866 对应 Agilent Expression Study，GSE22867 对应 Illumina 平台部分，具体信息需参考各子系列。该数据集围绕胶质母细胞瘤的 DNA 甲基化 profiling 展开，并关注甲基化对基因表达与临床结局的影响，适合作为脑肿瘤分子机制与转录组关联研究的参考资源。
【数据集背景】
胶质母细胞瘤是脑肿瘤研究中的重要对象，其分子层面的异常调控机制受到广泛关注。该数据集以 DNA 甲基化谱为切入点，研究主题同时涉及基因表达变化与临床结局，体现了从表观遗传修饰到转录组表现再到临床关联的研究思路。数据集名称明确指向“DNA Methylation Profiling of Glioblastoma: Impact on Gene Expression and Clinical Outcome”，主题标签为 Transcriptomics，说明其数据组织与转录组学分析密切相关。本站将其归类为肿瘤 / 脑肿瘤，便于在肿瘤学与神经肿瘤相关资源中进行检索与定位。
【数据内容】
该数据集为 SuperSeries 结构，由两个子系列构成。其一为 GSE22866，对应 Agilent Expression Study；其二为 GSE22867，对应 Illumina 部分。源站描述明确指出，该 SuperSeries 由上述子系列组成，具体数据内容应参考各个子系列。就整体主题而言，数据内容围绕胶质母细胞瘤的 DNA 甲基化谱展开，并关联基因表达与临床结局的分析方向。主题标签为 Transcriptomics，表明转录组学是该数据集的重要组织维度。除上述子系列名称与平台指向外，各子系列的具体样本数量、检测位点、表达指标与临床变量等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 omicsdi.org。源站描述表明其为一个 SuperSeries，包含 GSE22866 与 GSE22867 两个子系列，分别对应 Agilent Expression Study 与 Illumina 相关数据。数据集的英文全称为 DNA Methylation Profiling of Glioblastoma: Impact on Gene Expression and Clinical Outcome。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、受试者来源与纳入标准等采集层面的具体信息，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题与分类，该数据集可适用于胶质母细胞瘤 DNA 甲基化与基因表达关联分析的研究场景，也可作为脑肿瘤转录组学研究的参考数据。由于数据集名称同时涉及基因表达与临床结局，其适用方向可包括探索甲基化谱与表达变化之间的关系，以及在临床结局分析框架下考察分子特征的意义。主题标签 Transcriptomics 提示其可用于转录组层面的数据整合与比较研究。本站分类为肿瘤 / 脑肿瘤，适合在肿瘤分子机制与神经肿瘤研究中进行资源检索。关于具体分析流程、统计方法与验证场景，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 SuperSeries 形式组织，使用时需分别参考 GSE22866 与 GSE22867 两个子系列。源站描述明确提示“Refer to individual Series”，即具体的数据结构、平台信息与分析入口应以各子系列为准。对于 Agilent Expression Study 部分，可结合其表达研究定位进行使用；对于 Illumina 部分，则依据该子系列所对应的数据内容进行使用。关于下载方式、文件格式、预处理步骤与配套分析工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 SuperSeries，其整体描述依赖于两个子系列的组合，源站未提供统一的质量评估指标、数据完整性说明或批次效应处理信息。由于具体内容需参考各子系列，使用者在整合两个子系列时应注意平台差异，例如 Agilent Expression Study 与 Illumina 部分在技术层面的不同。关于样本量、缺失值、重复性验证与临床结局数据的完整程度，源站未提供。因此，在开展跨子系列比较或汇总分析时，应以各子系列的原始说明为准，并谨慎对待未在源站描述中明确的信息。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 omicsdi.org，英文名称为 DNA Methylation Profiling of Glioblastoma: Impact on Gene Expression and Clinical Outcome，包含 GSE22866 与 GSE22867 两个子系列。关于引用格式、作者列表、发表文献、数据许可协议与使用条款等引用与许可层面的具体信息，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时，应参考源站及各子系列的官方说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-22891
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本超级系列由以下子系列组成：GSE22866：胶质母细胞瘤DNA甲基化谱分析：对基因表达和临床结果的影响（Agilent表达研究） GSE22867：胶质母细胞瘤DNA甲基化谱分析：对基因表达和临床结果的影响（Illumina） 请参阅各个系列
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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