DeepHisto：全切片图像胶质瘤亚型分类数据集-84363

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.7941079

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 21.29 GB。

数据说明

DeepHisto数据集包含28例成人型弥漫性胶质瘤病例的苏木精-伊红染色全切片图像（WSI）的图块（切片块），这些病例于2017年至2021年间在卢森堡国家健康实验室（Laboratoire national de santé - LNS）的国家病理学中心（NCP）收集。WSI使用Philips公司的IntelliSite Ultra Fast数字切片扫描仪获取，配备20x/0.75 NA Plan Apo物镜，平均切片分辨率为0.25μm/像素。根据世界卫生组织中枢神经系统肿瘤分类第5版，三种原发性弥漫性胶质瘤亚型被分类为IDH突变、1p/19q共缺失少突胶质细胞瘤，IDH突变型星形细胞瘤，以及IDH野生型胶质母细胞瘤。非癌症患者的脑WSI被用作正常脑（白质和灰质）对照。WSI的区域标注由一位经委员会认证的病理学家完成，感兴趣区域进一步划分为512×512的正方形图块，每个图块关联一个特定类别，表示相应的肿瘤实体、正常脑组织或坏死。图块进一步按患者划分为训练子集和测试子集。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。