高危人类副神经节瘤深度膜蛋白质组分析

主题标签:肿瘤、脑肿瘤、副神经节瘤、膜蛋白质组、蛋白质组学。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。本数据集为肿瘤领域的时间序列公开数据集,来源:google_dataset,主题涵盖肿瘤。

google_dataset
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时间序列肿瘤脑肿瘤副神经节瘤膜蛋白质组蛋白质组学
Deep membrane proteome profiling of high-risk human paraganglioma

基本信息

模态
时间序列
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

高危人类副神经节瘤深度膜蛋白质组分析

Deep membrane proteome profiling of high-risk human paraganglioma 是一个面向肿瘤研究领域的公开蛋白质组学数据集,主题涵盖肿瘤与脑肿瘤,并聚焦于副神经节瘤这一特定肿瘤类型的膜蛋白质组分析。该数据集由 Ondrej Vit 提交,收录于 EBI(欧洲生物信息研究所)的 PRIDE 蛋白质组学数据存档平台,项目编号为 PXD029344。从主题构成看,数据集围绕高风险人类副神经节瘤的深层膜蛋白质组展开,涉及肿瘤、脑肿瘤、副神经节瘤、膜蛋白质组与蛋白质组学等关键词,可为相关领域的研究者提供一份可公开获取的蛋白质组学数据资源,用于了解该肿瘤类型在膜蛋白层面的研究材料构成。

【数据集背景】

副神经节瘤是一类起源于神经嵴相关副神经节组织的肿瘤,在肿瘤学与神经相关肿瘤研究中具有特定的关注价值。膜蛋白位于细胞膜及细胞器膜系统上,承担物质转运、信号转导与细胞间相互作用等功能,其表达与组成变化常与肿瘤的发生发展、侵袭及治疗响应相关。因此,针对高风险人类副神经节瘤开展膜蛋白质组的深度分析,属于蛋白质组学与肿瘤研究交叉的应用方向。该数据集正是在这一背景下公开的数据资源,其标题明确指向“高风险人类副神经节瘤”的“深层膜蛋白质组”分析,主题标签同时覆盖肿瘤与脑肿瘤,说明其在肿瘤研究分类中具有明确的归属。

【数据内容】

该数据集的主题涵盖肿瘤,具体围绕高风险人类副神经节瘤的膜蛋白质组展开,关键词包括肿瘤、脑肿瘤、副神经节瘤、膜蛋白质组与蛋白质组学。数据集名称表明其内容与膜蛋白质组的深度分析相关,属于蛋白质组学数据范畴。关于样本数量、蛋白鉴定数量、定量结果、实验分组、文件格式与数据规模等具体内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,即欧洲生物信息研究所的公开数据平台,具体收录于 PRIDE 蛋白质组学数据存档,项目访问编号为 PXD029344。数据集的提交者为 Ondrej Vit,源站描述中给出的引用形式为“Ondrej Vit, Deep membrane proteome profiling of high-risk human paraganglioma [Dataset]”,并附有对应的项目链接。关于样本采集地点、伦理审批信息、临床特征与实验流程细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题构成,该数据集可适用于肿瘤学与蛋白质组学相关的研究场景,尤其是围绕副神经节瘤的膜蛋白层面分析、肿瘤相关膜蛋白的候选筛选与验证、以及蛋白质组学数据的二次利用与比较研究。由于主题标签同时包含脑肿瘤,也可作为神经系统相关肿瘤研究中的参考数据资源。关于该数据集在具体研究中的适用性验证与预期用途,源站未提供。

【使用方法】

该数据集为公开数据集,可通过源站给出的项目链接访问 PRIDE 存档中的项目页面,按平台常规方式获取与使用。关于数据下载的具体文件组织、检索方式、分析流程与软件参数,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为公开存档的蛋白质组学数据集,其质量评估信息、数据完整性说明与已知技术限制,源站未提供。使用者在开展二次分析时,应结合源站项目页面的原始说明进行判断。关于样本量、覆盖深度与重复性等具体质量指标,源站未提供。

【引用与许可】

引用该数据集时,可参照源站描述给出的形式:Ondrej Vit, Deep membrane proteome profiling of high-risk human paraganglioma [Dataset], https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD029344。关于该数据集的具体许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD029344

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Ondrej Vit, Deep membrane proteome profiling of high-risk human paraganglioma [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD029344

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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