弥漫性中线胶质瘤中特定cPRC1复合物介导致癌基因抑制数据集
主题标签:肿瘤、脑肿瘤、弥漫性中线胶质瘤、cPRC1复合物、致癌基因抑制、PRIDE。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。

基本信息
资源简介
弥漫性中线胶质瘤中特定cPRC1复合物介导致癌基因抑制数据集
该数据集英文名为“Data from: Specific cPRC1 complexes are co-opted to mediate oncogenic gene repression in diffuse midline glioma”,来自 ebi.ac.uk(PRIDE 数据库),在本站归类于肿瘤 / 脑肿瘤方向。数据集围绕弥漫性中线胶质瘤这一脑肿瘤类型展开,主题涉及 cPRC1 复合物与致癌基因抑制之间的关系,属于肿瘤领域的公开数据集。源站将其登记为 Alex von Kriegsheim 于 2025 年发布的数据集,并提供了对应的 PRIDE 项目访问地址。以下依据可获得的信息,从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
弥漫性中线胶质瘤是一种发生于中枢神经系统中线结构的脑肿瘤,属于肿瘤研究的重要对象。该数据集所对应的研究关注 cPRC1 复合物在弥漫性中线胶质瘤中的作用,特别是特定 cPRC1 复合物被“co-opted”(被劫持或征用)以介导致癌基因抑制这一主题。数据集的主题标签包括肿瘤、脑肿瘤、弥漫性中线胶质瘤、cPRC1 复合物、致癌基因抑制以及 PRIDE,反映出其研究焦点集中在表观遗传调控复合物与肿瘤基因表达抑制机制之间的关联。该数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤,可供相关研究方向参考使用。
【数据内容】
该数据集为 PRIDE 数据库收录的蛋白质组学相关数据集,源站描述中给出的名称为“Specific cPRC1 complexes are co-opted to mediate oncogenic gene repression in diffuse midline glioma”。关于数据集内具体包含的样本数量、文件类型、原始质谱数据与鉴定结果等详细内容,源站未提供。数据集的主题标签表明其内容与弥漫性中线胶质瘤中的 cPRC1 复合物及致癌基因抑制研究相关,但具体数据构成需以源站项目页面为准。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,具体为 PRIDE 归档项目,项目访问地址为 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD058532。源站描述将其标注为 Alex von Kriegsheim(2025)发布的数据集。关于样本采集方式、实验设计、仪器平台、数据处理流程等采集细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤特别是脑肿瘤相关研究领域,尤其是弥漫性中线胶质瘤的分子机制研究。其主题涉及 cPRC1 复合物与致癌基因抑制,可用于表观遗传调控、基因表达抑制机制以及蛋白质组学数据分析等方向的参考。由于数据集为公开数据集,也可用于方法比较、结果复现或二次分析等场景。具体适用性需结合源站项目页面的数据说明判断。
【使用方法】
该数据集可通过 PRIDE 项目页面(https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD058532)访问和获取。关于数据下载格式、分析工具、使用步骤等具体方法,源站未提供。使用者应参照 PRIDE 平台的一般使用方式及项目页面的说明进行操作。
【质量与限制】
该数据集经 PRIDE 平台归档,源站提供了项目编号与发布者信息。关于数据质量评估指标、完整性、批次效应、技术偏差等质量相关信息,源站未提供。使用时应注意到数据集主题集中于特定肿瘤类型与特定复合物,其结论的外推范围需谨慎对待。其他限制信息源站未提供。
【引用与许可】
引用该数据集时,可参照源站描述:Alex von Kriegsheim (2025). Specific cPRC1 complexes are co-opted to mediate oncogenic gene repression in diffuse midline glioma [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD058532。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供,使用者应查阅项目页面或联系数据发布者确认。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD058532
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Alex von Kriegsheim (2025). Specific cPRC1 complexes are co-opted to mediate oncogenic gene repression in diffuse midline glioma [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD058532
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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