构建miRNA panel作为区分胶质母细胞瘤与腺癌来源脑转移患者的潜在生物标志物:基于下一代测序

该数据集来自omicsdi.org,主题为肿瘤/脑肿瘤,标签为Genomics。其内容围绕利用下一代测序构建miRNA panel,以作为区分胶质母细胞瘤与腺癌来源脑转移患者的潜在生物标志物

omicsdi
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基因组分类Genomics
Construction of a miRNA panel as possible biomarker for separation of glioblastoma and brain metastasis patients with adenocarcinoma origin using next-generation sequencing

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

构建miRNA panel作为区分胶质母细胞瘤与腺癌来源脑转移患者的潜在生物标志物:基于下一代测序

该数据集围绕利用下一代测序技术构建miRNA panel展开,旨在探索其作为潜在生物标志物,用于区分胶质母细胞瘤与腺癌来源的脑转移患者。数据集英文名称为“Construction of a miRNA panel as possible biomarker for separation of glioblastoma and brain metastasis patients with adenocarcinoma origin using next-generation sequencing”,来源站为omicsdi.org,本站分类归入肿瘤/脑肿瘤,主题标签为Genomics。整体来看,该数据集属于基因组学与肿瘤学交叉领域,聚焦于脑肿瘤中两类不同来源病变的分子鉴别问题,即原发性胶质母细胞瘤与腺癌来源的脑转移瘤之间的区分。其核心思路是通过下一代测序获取miRNA表达信息,并在此基础上构建一个可能的miRNA panel,以评估其作为分离两类患者群体的生物标志物潜力。

【数据集背景】

脑肿瘤的鉴别诊断在临床与研究中具有重要意义,尤其是胶质母细胞瘤与腺癌来源的脑转移患者,二者在治疗策略和预后判断上存在差异。该数据集正是在这一背景下产生,试图借助下一代测序技术,从miRNA层面寻找可用于区分这两类患者的分子特征。主题标签为Genomics,说明其数据内容属于基因组学范畴,关注的是与基因表达调控相关的分子信息。源站描述与数据集英文名称一致,均强调“construction of a miRNA panel”以及“possible biomarker”的定位,表明该数据集并非单纯的测序数据集合,而是围绕生物标志物构建这一目标组织起来的研究资源。

【数据内容】

该数据集的内容围绕利用下一代测序构建miRNA panel展开,以作为区分胶质母细胞瘤与腺癌来源脑转移患者的潜在生物标志物。其主题标签为Genomics,表明数据涉及基因组学层面的信息。关于具体的样本数量、测序平台、miRNA数量、panel组成、表达矩阵或统计结果等细节,源站未提供。因此,无法进一步说明数据文件中包含哪些具体字段、格式或规模。

【采集与来源】

该数据集来源站为omicsdi.org,本站分类为肿瘤/脑肿瘤。其英文名称明确指向使用下一代测序技术,研究对象为胶质母细胞瘤与腺癌来源的脑转移患者。关于样本采集地点、采集时间、纳入排除标准、伦理审批信息、测序中心或具体实验流程等,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于与脑肿瘤分子鉴别相关的研究场景,尤其是探索miRNA作为生物标志物以区分胶质母细胞瘤和腺癌来源脑转移患者的分析工作。其主题标签Genomics也提示,该数据可用于基因组学背景下关于miRNA表达特征的研究。关于是否适用于临床诊断、预后评估、治疗靶点筛选或其他具体应用,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过来源站omicsdi.org获取。关于数据下载方式、文件组织格式、是否需要特定分析工具、是否提供预处理流程或分析脚本等,源站未提供。使用者如需利用该数据构建或验证miRNA panel,应依据来源站提供的实际数据说明进行操作。

【质量与限制】

该数据集为利用下一代测序构建miRNA panel以区分胶质母细胞瘤与腺癌来源脑转移患者的潜在生物标志物研究相关数据。关于数据质量评估、批次效应、样本量充分性、验证队列、统计效力、潜在偏倚或局限性等,源站未提供。因此,无法对数据质量与限制做出进一步判断。

【引用与许可】

该数据集来源站为omicsdi.org,英文名称为“Construction of a miRNA panel as possible biomarker for separation of glioblastoma and brain metastasis patients with adenocarcinoma origin using next-generation sequencing”。关于引用方式、许可协议、使用限制或版权信息等,源站未提供。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA1200650

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

构建一个可能的miRNA面板作为生物标志物,用于通过下一代测序技术区分胶质母细胞瘤和腺癌来源的脑转移患者

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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