JQ1处理的肿瘤细胞中转录调控因子与RNA聚合酶II的ChIP-Seq

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JQ1处理的肿瘤细胞中转录调控因子与RNA聚合酶II的ChIP-Seq

该数据集为ChIP-Seq数据，覆盖多发性骨髓瘤（MM.1S）、胶质母细胞瘤（U87-MG）和小细胞肺癌（H2171）三种肿瘤细胞系，在经BET bromodomain抑制剂JQ1处理后，对RNA聚合酶II及转录调控因子进行ChIP-Seq检测。数据集英文名为ChIP-Seq for transcriptional regulators and RNA Polymerase II in tumor cells treated with JQ1，本站分类为肿瘤 / 脑肿瘤，来源站为omicsdi.org，主题标签为Genomics。整体而言，该数据集围绕JQ1处理后的肿瘤细胞，通过染色质免疫共沉淀测序技术，检测RNA聚合酶II及转录调控因子在基因组上的结合情况，为研究BET bromodomain抑制对转录调控的影响提供数据基础。

【数据集背景】

该数据集来源于omicsdi.org，主题标签为Genomics，本站分类为肿瘤 / 脑肿瘤。其涉及的实验背景为：在多种肿瘤细胞中，使用BET bromodomain抑制剂JQ1进行处理，随后开展ChIP-Seq检测。源站描述指出，该数据集针对RNA Polymerase II以及转录调控因子进行ChIP-Seq，涉及的细胞系包括多发性骨髓瘤（MM.1S）、胶质母细胞瘤（U87-MG）和小细胞肺癌（H2171）。这些细胞系分别代表多发性骨髓瘤、胶质母细胞瘤和小细胞肺癌。该系列实验的其他数据集已作为GSE42355的一部分发布。

【数据内容】

该数据集的核心内容为ChIP-Seq数据，检测对象包括RNA聚合酶II和转录调控因子。实验覆盖三种肿瘤细胞系：MM.1S（多发性骨髓瘤）、U87-MG（胶质母细胞瘤）和H2171（小细胞肺癌）。这些细胞系均经过BET bromodomain抑制剂JQ1处理，处理浓度范围为5nM至5µM。处理后进行ChIP-Seq，以获取RNA聚合酶II及转录调控因子在基因组上的结合信息。数据集英文名明确指向“transcriptional regulators and RNA Polymerase II in tumor cells treated with JQ1”，主题标签为Genomics。

【采集与来源】

数据来源站为omicsdi.org。根据源站描述，实验流程为：将代表多发性骨髓瘤、胶质母细胞瘤和小细胞肺癌的细胞系（MM.1S、U87-MG、H2171）用不同浓度的BET bromodomain抑制剂JQ1（5nM至5µM）处理，随后进行ChIP-Seq，检测RNA Polymerase II和转录调控因子。该系列实验的其他数据集已作为GSE42355的一部分发布。本站分类为肿瘤 / 脑肿瘤，主题标签为Genomics。

【适用场景】

该数据集适用于研究BET bromodomain抑制剂JQ1对肿瘤细胞转录调控的影响。具体而言，可用于分析在MM.1S、U87-MG和H2171三种细胞系中，JQ1处理后RNA聚合酶II及转录调控因子在基因组上的结合变化。由于涉及多发性骨髓瘤、胶质母细胞瘤和小细胞肺癌，该数据集可服务于肿瘤生物学、脑肿瘤研究以及转录调控机制探索等场景。主题标签Genomics表明其适用于基因组学相关分析。

【使用方法】

源站未提供。

【质量与限制】

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【引用与许可】

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