胶质母细胞瘤中促进少突胶质祖细胞样细胞分化与静息的候选通路

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-30626

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

成熟的中枢神经系统包含PDGFRA+的“少突胶质前体细胞”（OPC），这些细胞可能保持静息状态、增殖或分化为少突胶质细胞。在人类胶质瘤中，经常观察到类似于OPC的快速增殖的Olig2+细胞。我们试图在体内识别OPC分化或静息状态独特需要的候选途径。利用bacTRAP方法，我们生成并分析了小鼠品系，用于在正常小鼠大脑中对主要细胞类型（包括OPC）进行翻译谱分析。随后，我们对来自Pdgf驱动胶质瘤小鼠模型的少突胶质（Olig2+）细胞进行了谱分析。该分析证实，Olig2+肿瘤细胞与OPC最为相似，但也识别出关键祖细胞基因的差异——这些是促进分化或静息状态的候选基因。此处有两个数据集。一个描述了神经元、星形胶质细胞、成熟和未成熟少突胶质细胞的正常翻译谱。每种细胞类型均从至少两只小鼠的混合样本中进行三次重复分析，并平行收集总RNA对照。

第二个数据集包含了来自几种胶质瘤小鼠模型变体中Olig2阳性细胞的翻译谱。每种变体至少收集了三份样本，并平行分析了总RNA对照。所有翻译谱均采用翻译核糖体亲和纯化方案生成。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。