微阵列鉴定胶质母细胞瘤复发候选基因
该数据集来自 omicsdi.org，主题为转录组学，聚焦胶质母细胞瘤（GBM）复发相关候选基因。数据基于微阵列分析，比较人 GBM 肿瘤主体、距肿瘤边界 1-3cm 的周围组织以及正常白质，样本来自接受全肿瘤切除的患者和因非恶性病变接受手术的患者
基本信息
资源简介
微阵列鉴定胶质母细胞瘤复发候选基因
该数据集名为 Candidate genes for the recurrence of glioblastoma multiforme identified by microarray，收录于 omicsdi.org，本站分类为肿瘤 / 脑肿瘤，主题标签为转录组学。数据集聚焦胶质母细胞瘤（GBM）复发相关的候选基因，采用微阵列分析手段，比较人 GBM 肿瘤主体、距肿瘤边界 1-3cm 的周围组织以及正常白质之间的分子特征。样本来自接受全肿瘤切除的患者，以及因非恶性病变接受手术的患者。整体而言，该数据集旨在从转录组层面刻画 GBM 肿瘤周边白质区域的分子改变，为理解肿瘤复发机制提供候选基因线索。
【数据集背景】
胶质母细胞瘤（GBM）是最具侵袭性、最致命的原发性恶性脑肿瘤，诊断后生存率通常不足一年。当前手术方式试图切除大部分肿瘤组织，但 GBM 常在距原发肿瘤切除部位 1-3cm 范围内复发。肿瘤复发的分子机制目前仍知之甚少。该研究的目标是定义 GBM 周围白质（WM）的分子特征，以更好地理解与肿瘤复发相关的分子机制。这一背景构成了该数据集的核心科学问题，即通过转录组水平的比较分析，寻找与 GBM 复发相关的候选基因。
【数据内容】
该数据集的主题为转录组学，数据基于微阵列分析产生。研究比较了人 GBM 肿瘤主体、距肿瘤边界 1-3cm 的周围组织以及正常白质。通过这种分组比较，数据集可用于识别在肿瘤主体与周围组织、正常白质之间存在表达差异的候选基因。数据集名称明确指向“通过微阵列鉴定的胶质母细胞瘤多形性复发候选基因”，因此其内容核心是复发相关候选基因的微阵列检测结果。关于具体的基因数量、表达值范围、统计显著性指标等，源站未提供。
【采集与来源】
样本采集自接受全肿瘤切除的患者，获取人 GBM 肿瘤主体及距肿瘤边界 1-3cm 的周围组织；正常白质则采集自因非恶性病变接受手术的患者。研究共涉及五名接受全肿瘤切除的患者。数据来源站为 omicsdi.org。关于样本的具体处理流程、微阵列平台型号、RNA 提取方法、杂交条件等实验细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于胶质母细胞瘤复发机制的研究，尤其是围绕肿瘤周边白质区域分子改变的分析。可用于筛选与 GBM 复发相关的候选基因，也可用于转录组水平的比较研究，例如肿瘤主体与周围组织、正常白质之间的表达差异分析。此外，该数据集可为后续验证性实验提供候选基因列表，或用于与其它 GBM 转录组数据集的整合分析。关于是否适用于临床诊断、预后预测或药物靶点开发等具体应用，源站未提供明确说明。
【使用方法】
该数据集来自 omicsdi.org，可通过该来源站获取。关于具体的数据下载方式、文件格式、数据预处理步骤、标准化方法、分析工具或代码等，源站未提供。使用者如需使用该数据集，应参考来源站提供的原始说明和元数据。关于是否需要申请权限、是否提供原始数据或仅提供处理后数据，源站未提供。
【质量与限制】
该研究涉及五名接受全肿瘤切除的患者，样本量较小。数据基于微阵列分析，属于转录组学层面，可能无法全面反映蛋白质水平或表观遗传调控。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应、验证实验等信息，源站未提供。此外，正常白质来自因非恶性病变接受手术的患者，其与 GBM 患者正常白质之间的可比性需谨慎考虑。关于具体的限制说明，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、版权信息等，源站未提供。使用者应直接访问 omicsdi.org 获取相关引用与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-13276
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
背景：多形性胶质母细胞瘤（GBM）是最具侵袭性且最致命的原发性恶性脑肿瘤，诊断后生存率不足一年。目前的手术方式试图切除大部分肿瘤组织，而GBM常在距原发肿瘤切除部位1-3cm范围内复发。肿瘤复发的分子机制仍知之甚少。本研究旨在明确GBM周围白质（WM）的分子特征，以更好地理解与肿瘤复发相关的分子机制。材料与方法：从五名接受全肿瘤切除术的患者中获取人GBM肿瘤主体及周围组织（距肿瘤边缘1-3cm），同时从因非恶性病变接受手术的患者中采集正常白质。样本经处理后与Affymetrix Human U133A芯片进行杂交，数据使用GeneSpring分析软件进行检测。结果：样本的基因表达分析分两个独立步骤进行。
首先，对GBM周围白质与正常白质进行分子谱比较，发现两种组织间有59个基因存在差异表达。其中，由成熟神经细胞表达的众多基因在GBM周围白质中下调，而支持侵袭的基因产物则过表达。此外，KLRC1——一种天然参与抗肿瘤细胞激活的特异性自然杀伤受体——在GBM周围白质中受到显著抑制，提示该组织中的抗肿瘤免疫监视功能受损。其次，我们将研究重点放在GBM周边相对于GBM核心特异性调控的基因上。GBM周围组织中上调最高的基因编码DTX4，这是一种NOTCH信号通路的调控因子，因其在维持神经祖细胞处于未定向状态中的关键作用而被描述。结论：本
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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