基于MRI与DICOM-RT的伽玛刀放疗后脑肿瘤复发预测开放标注数据集与基线算法
在此我们发布一个脑癌MRI数据集,并附带伽玛刀治疗计划与随访数据,用于肿瘤复发预测。该数据集由47名受试者组成。共收集了244个病灶并带有标注

基本信息
资源简介
基于MRI与DICOM-RT的伽玛刀放疗后脑肿瘤复发预测开放标注数据集与基线算法
在此我们发布一个脑癌MRI数据集,并附带伽玛刀治疗计划与随访数据,用于肿瘤复发预测。该数据集由47名受试者组成。共收集了244个病灶并带有标注
Brain Tumor Recurrence Prediction after Gamma Knife Radiotherapy from MRI and Related DICOM-RT: An Open Annotated Dataset and Baseline Algorithm (Brain-TR-GammaKnife)
【数据集背景】
源站首次发布:2023。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):在此我们发布一个脑癌MRI数据集,并附带伽玛刀治疗计划与随访数据,用于肿瘤复发预测。该数据集由47名受试者组成。共收集了244个病灶并带有标注。数据集包含原始患者MRI图像(DICOM格式)、放射治疗结构数据(DICOM和NRRD格式)、代码以及临床信息。首先,通过线性变换将剂量MRI图像重采样至原始MRI间距。其次,提取并裁剪每位患者MRI中的每个区域;注意,一位患者可能有多个病灶和/或多个成像会话。第三,将相应的放射剂量信息裁剪至重采样对齐后的病灶掩膜。通过这种方式,每个病灶MRI与其放射剂量MRI配对。该数据集的发布预期将有助于开发
【主题与分类】
主题标签:脑肿瘤、肿瘤复发预测、MRI、DICOM-RT、伽玛刀放疗、医学影像、开放标注数据集。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://www.cancerimagingarchive.net/collection/brain-tr-gammaknife/
使用许可:NIH Controlled Data Access Policy。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.7937/xb6d-py67
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们在此发布一个脑癌MRI数据集,附带伽玛刀治疗计划及随访数据,旨在用于肿瘤复发预测。该数据集包含47名受试者,共收集了244个带有注释的病灶。数据集包括原始患者MRI图像(DICOM格式)、放射治疗结构数据(DICOM和NRRD格式)、代码及临床信息。首先,通过线性变换将剂量MRI图像重采样至原始MRI间距。其次,提取并裁剪出每位患者MRI中的每个区域;需注意,一名患者可能有多个病灶和/或多个成像时段。第三,将相应的放射剂量信息裁剪至重采样对齐后的病灶掩模。如此,每个病灶MRI与其放射剂量MRI配对。此数据集的发布预期将促进自动化脑肿瘤复发预测算法的发展。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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