IDHR132H突变型星形细胞瘤单核ATAC测序样本

资源简介

IDHR132H突变型星形细胞瘤单核ATAC测序样本

该数据集收录于omicsdi.org，主题标签为Genomics，本站分类归入肿瘤/脑肿瘤方向。其内容为IDHR132H突变型星形细胞瘤的单核ATAC测序样本，来源于一名64岁男性低级别人类胶质瘤患者。测序平台为NovaSeq6000，上传文件为基于grch38参考基因组构建的bam文件。整体来看，该数据集提供了针对特定IDH突变型星形细胞瘤的单核染色质可及性测序信息，可用于探索低级别胶质瘤在单细胞核水平上的基因组调控特征，属于肿瘤基因组学与脑肿瘤研究交叉领域的数据资源。

【数据集背景】

该数据集聚焦于IDHR132H突变型星形细胞瘤。星形细胞瘤是起源于星形胶质细胞的一类脑肿瘤，而IDH基因突变是低级别胶质瘤中常见的分子特征之一。本数据集所涉及的样本为低级别人类胶质瘤，携带IDHR132H突变，来源于一名64岁男性。通过单核ATAC测序技术，该数据集旨在从染色质可及性角度反映肿瘤样本中细胞核层面的调控状态。其主题标签为Genomics，本站分类为肿瘤/脑肿瘤，来源站为omicsdi.org。这些背景信息表明该数据集属于脑肿瘤基因组学研究中针对特定分子亚型的数据资源。

【数据内容】

该数据集的核心内容是单核ATAC测序数据。ATAC测序用于检测染色质开放区域，从而反映转录调控元件的可及性。本数据集来源于IDHR132H突变型星形细胞瘤的低级别人类胶质瘤样本，样本提供者为64岁男性。上传的文件为bam文件，这些bam文件是基于grch38参考基因组创建的。数据集英文名称为a5960aca-c801-4da7-88c5-b348c9970c05 - samples。除上述信息外，关于样本的具体数量、测序深度、数据量大小、文件数目等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为omicsdi.org。样本来自一名64岁男性的低级别人类胶质瘤，具体为IDHR132H突变型星形细胞瘤。测序使用NovaSeq6000平台完成。上传的数据文件为bam格式，并基于grch38参考基因组生成。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息、机构来源以及处理流程的详细步骤，源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息，该数据集适用于与IDHR132H突变型星形细胞瘤及低级别胶质瘤相关的基因组学研究，尤其是涉及单核ATAC测序的分析场景。研究人员可利用该数据探索染色质可及性特征，或将其作为脑肿瘤分子亚型研究中的参考数据。主题标签Genomics也表明其可应用于基因组学相关分析。然而，关于该数据集在具体疾病机制、生物标志物发现或临床转化中的明确用途，源站未提供。

【使用方法】

该数据集提供的文件为基于grch38参考基因组创建的bam文件。使用者可根据单核ATAC测序数据的常规处理流程，对这些bam文件进行后续分析。由于数据来源于NovaSeq6000平台，分析时需考虑该平台的测序特征。关于具体的分析软件、参数设置、质控标准或推荐流程，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为单核ATAC测序数据，样本为64岁男性的低级别人类胶质瘤，携带IDHR132H突变。数据文件为基于grch38的bam文件。关于数据质量指标，如测序质量值、比对率、重复率、细胞核捕获数、片段大小分布等，源站未提供。此外，该数据集仅涉及单一性别和年龄的样本，关于其是否具有群体代表性或可推广性，源站未提供。使用时应结合具体研究目的评估其适用性。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或数据访问政策，源站未提供。使用者应参考来源站omicsdi.org的相关规定。