新型六-CpGs特征预测胶质母细胞瘤临床结局
该数据集来自omicsdi.org，聚焦胶质母细胞瘤（GBM）的DNA甲基化信息，旨在识别有临床价值的生物标志物以优化患者管理
基本信息
资源简介
新型六-CpGs特征预测胶质母细胞瘤临床结局
该数据集英文名为“A novel six-CpGs signature predicts clinical outcome in glioblastomas”，来自omicsdi.org，聚焦胶质母细胞瘤（GBM）的DNA甲基化信息，旨在识别具有临床价值的生物标志物，以优化GBM患者的管理。研究基于DNA甲基化信息构建了一个由六个CpG位点组成的新型特征签名，用于预测GBM的临床结局。数据集包含79例GBM患者的甲基化谱数据，作为验证队列用于展示该六-CpGs签名的性能和稳健性；同时，每个样本还标注了临床医生传统上用于预测GBM生存的“MGMT”生物标志物状态。该数据集在站内归类为肿瘤/脑肿瘤，主题标签为Transcriptomics。
【数据集背景】
胶质母细胞瘤（GBM）是临床管理难度较大的脑肿瘤类型，寻找能够辅助临床决策的生物标志物是该领域的重要研究方向。该数据集所对应的研究以DNA甲基化信息为基础，目标是识别一个有临床实用价值的生物标志物，从而优化GBM患者的管理。研究最终确定了一个由六个CpG位点构成的新型特征签名，用于预测GBM的临床结局。这一背景信息说明了数据集的核心科学问题：如何利用甲基化层面的信息为GBM的预后判断和患者管理提供支持。
【数据内容】
数据集的核心内容是79例GBM患者的甲基化谱数据，这些数据被用作验证队列，以展示所识别的六-CpGs签名的性能与稳健性。除甲基化谱外，每个样本还附带“MGMT”生物标志物的状态信息；MGMT是临床医生传统上用于预测GBM生存的标志物，其逐样本标注为数据增加了与传统临床指标对照的维度。数据集的主题标签为Transcriptomics，站内分类为肿瘤/脑肿瘤。
【采集与来源】
该数据集来源于omicsdi.org。源站描述说明，研究旨在利用DNA甲基化信息识别有临床价值的生物标志物，以优化GBM患者的管理，并采用79例GBM患者的甲基化谱作为验证队列来证明六-CpGs签名的性能和稳健性。关于样本采集的具体时间、地点、机构、伦理审批及处理流程等信息，源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息，该数据集适用于围绕GBM预后生物标志物开展的研究场景，尤其是对六-CpGs签名预测临床结局的性能与稳健性进行验证性分析；也可用于考察甲基化特征与MGMT状态之间的关系，或比较新型签名与传统MGMT标志物在生存预测中的表现。此外，该数据集可用于DNA甲基化信息在GBM患者管理优化中的方法学探索。其他具体应用场景源站未提供。
【使用方法】
源站描述表明，79例GBM患者的甲基化谱被作为验证队列使用，以演示六-CpGs签名的性能和稳健性，并且每个样本均标注了MGMT状态。因此，使用该数据集时，可围绕这79例样本的甲基化谱评估六-CpGs签名的预测表现，并结合逐样本的MGMT状态进行对照分析。关于数据文件格式、字段结构、预处理步骤、签名中六个CpG位点的具体定义及分析代码等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集以79例GBM患者作为验证队列，用于展示六-CpGs签名的性能与稳健性，样本还带有MGMT状态标注，这些构成了数据集可用性的基本依据。但关于样本量是否足以覆盖不同临床亚组、数据是否存在缺失、批次效应或平台差异、随访信息是否完整等质量细节，源站未提供。此外，该数据集为验证队列性质，其结论的外推范围需结合源站未提供的更多研究信息加以判断。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、文献出处、许可协议及使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-4969
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在利用基于DNA甲基化的信息识别一种临床有用的生物标志物，以优化胶质母细胞瘤（GBM）患者的管理。我们识别出一个新型六CpG位点特征，可预测GBM的临床结局。79例GBM患者的甲基化谱被用作验证队列，以证明所识别的六CpG位点特征的性能和稳健性。传统上临床医生用于预测GBM生存期的“MGMT”生物标志物状态也按样本进行了标注。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
