分子预测器重新评估人II/III级胶质瘤分类

数据集获取（Figshare）

• 源站标题：A Molecular Predictor Reassesses Classification of Human Grade II/III Gliomas
• DOI：10.1371/journal.pone.0066574
• 发布日期：2013-06-21
• 文件数：6 个
• 文件总体积：1.90 MB
• 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_A_Molecular_Predictor_Reassesses_Classification_of_Human_Grade_II_III_Gliomas_/728041

命令行下载

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curl -L -o "Figure_S2.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/1096789"
curl -L -o "Table_S1.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/1096799"
curl -L -o "Table_S2.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/1096800"
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curl -L -o "Table_S4.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/1096802"

文件清单

• Figure_S1.pdf（142.97 KB）
• Figure_S2.pdf（468.14 KB）
• Table_S1.xls（1.15 MB）
• Table_S2.xls（89.60 KB）
• Table_S3.pdf（30.62 KB）
• Table_S4.pdf（17.24 KB）

文件总体积 1.90 MB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

弥漫性胶质瘤是无法治愈的脑肿瘤，根据组织学标准分为3个WHO级别（II级、III级、IV级）。II/III级胶质瘤在临床上具有高度异质性，其预后在一定程度上难以预测，从而妨碍了确定适当的治疗方案。在一个由65例II/III级胶质瘤患者组成的队列中，基于QPCR的方法筛选出一份具有生物学相关性的基因列表，并从中提取出一个与总生存期显著相关的基因特征。该特征将训练队列聚类为进展和死亡低风险与高风险两个类别，并同样将两个外部独立测试队列（分别包含104例和73例II/III级患者）聚类。一个基于22个基因的类别预测器可最优地将训练聚类中的预后差患者与预后好患者区分开来（验证队列中中位生存期分别为13–20个月与超过6年）。该分类在预测结局方面强于WHO II/III级分类（P≤2.8E-10 对 0.018）。在多变量分析中，与其他预后因素（组织学亚型和遗传异常）相比，22基因预测器仍与总生存期显著相关。

在临床常规中，早期预测高风险患者（占WHO II级的3%）和低风险患者（占WHO III级的29%），将有助于制定更合适的随访和治疗方案。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0066574（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_A_Molecular_Predictor_Reassesses_Classification_of_Human_Grade_II_III_Gliomas_/728041）。