89d709ae-4075-4a0f-bd93-1d18bba092d4 样本集

资源简介

89d709ae-4075-4a0f-bd93-1d18bba092d4 样本集

该数据集收录于 omicsdi.org，英文名称为 89d709ae-4075-4a0f-bd93-1d18bba092d4 - samples，本站分类归入肿瘤 / 脑肿瘤方向，主题标签为 Genomics。根据源站描述，该研究对 186 例患者肿瘤样本进行了 bulk RNA-seq 转录组测序，样本涵盖 38 例胚胎性脑肿瘤、101 例高级别胶质瘤、24 例低级别胶质瘤、10 例髓母细胞瘤以及 13 例配对的正常样本，并提供原始 fastq 文件。整体来看，这是一批面向脑肿瘤转录组研究的多亚型样本资源，可用于分子分型、分类研究以及肿瘤与正常组织之间的比较分析。

【数据集背景】

脑肿瘤是一类异质性较强的肿瘤类型，不同亚型在分子特征、组织来源和临床行为上存在明显差异。对该类肿瘤开展转录组水平的系统刻画，有助于理解其分子机制并支撑分型研究。该数据集正是围绕这一方向构建，来源站为 omicsdi.org，本站分类为肿瘤 / 脑肿瘤，主题标签为 Genomics。源站描述指出，研究者对 186 例患者肿瘤样本进行了 bulk RNA-seq 分析，样本覆盖胚胎性脑肿瘤、高级别胶质瘤、低级别胶质瘤、髓母细胞瘤以及配对的正常样本，体现出对多种脑肿瘤类型进行转录组比较的研究设计思路。

【数据内容】

该数据集的核心内容是 bulk RNA-seq 测序数据，共涉及 186 例患者肿瘤样本。按源站给出的构成，其中包括 38 例胚胎性脑肿瘤、101 例高级别胶质瘤、24 例低级别胶质瘤、10 例髓母细胞瘤，以及 13 例配对的正常样本。数据以原始 fastq 文件的形式提供。从样本构成看，高级别胶质瘤占比最高，其次为胚胎性脑肿瘤和低级别胶质瘤，髓母细胞瘤与配对正常样本数量相对较少。这些样本共同构成了一个可用于转录组层面比较与分析的数据集合。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org。源站描述说明，研究通过 bulk RNA-seq 对 186 例患者肿瘤样本进行了转录组测序，并提供原始 fastq 文件。关于样本采集的具体时间、地点、机构、伦理审批信息以及测序平台、建库方法、测序深度等技术细节，源站未提供。

【适用场景】

结合其主题标签与样本构成，该数据集可用于脑肿瘤的转录组分析、分子分型与分类研究，也可作为肿瘤与正常组织比较、差异表达分析及生物标志物探索的资源。由于样本涵盖胚胎性脑肿瘤、高级别胶质瘤、低级别胶质瘤、髓母细胞瘤和配对正常样本，适合开展跨亚型的表达特征比较，也适合在肿瘤与正常组织之间进行对照分析。此外，原始 fastq 文件的存在意味着使用者可以从原始读段出发，自行完成比对、定量等下游处理流程。

【使用方法】

该数据集以原始 fastq 文件形式提供，使用者通常需要先进行测序质量控制、读段比对或转录本定量，再开展差异表达、分型或分类等分析。由于包含配对正常样本，可在分析设计中纳入配对比较策略。关于具体的分析流程、推荐工具、参考基因组版本以及是否提供预处理后的表达矩阵，源站未提供。

【质量与限制】

源站描述仅说明了样本数量与类型构成，并指出提供原始 fastq 文件。关于测序质量、批次效应、样本纳入排除标准、临床信息完整度以及数据是否存在缺失或偏倚等信息，源站未提供。样本构成中各类肿瘤数量不均衡，高级别胶质瘤明显多于其他类型，配对正常样本为 13 例，这些构成特征可能影响分析设计，但源站未对其影响作出说明。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制以及数据访问权限等信息，源站未提供。