脑干胶质瘤原发肿瘤样本 RNAseq 数据

该数据集为脑干胶质瘤原发肿瘤样本的 RNAseq 数据,测序平台为 Illumina HiSeq X Ten,来源于 omicsdi.org,本站归类为肿瘤 / 脑肿瘤,主题标签为 Genomics

omicsdi
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基因组分类Genomics
782a0a9a-a024-4aa4-b2a6-3ed0312cdcb6 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

脑干胶质瘤原发肿瘤样本 RNAseq 数据

该数据集为脑干胶质瘤原发肿瘤样本的 RNA 测序数据,采用 Illumina HiSeq X Ten 平台完成测序,来源站为 omicsdi.org,在本站被归类于肿瘤 / 脑肿瘤方向,主题标签为 Genomics。从整体上看,这是一份围绕脑干胶质瘤这一特定中枢神经系统肿瘤类型产生的转录组层面数据资源,其核心价值在于以原发肿瘤样本为对象,通过高通量 RNA 测序获取基因表达层面的信息。脑干胶质瘤位于脑干区域,属于脑肿瘤中解剖位置特殊、临床处理难度较高的一类病变,因此针对该类肿瘤的分子层面数据对于理解其生物学特征具有基础性意义。该数据集以 RNAseq 为主要技术手段,测序平台明确为 Illumina HiSeq X Ten,数据主题归属于基因组学范畴,适合在肿瘤基因组学与脑肿瘤研究语境下被检索、引用和再利用。

【数据集背景】

该数据集所对应的研究对象为脑干胶质瘤原发肿瘤样本。脑干胶质瘤是发生于脑干区域的胶质来源肿瘤,属于脑肿瘤的一种,在本站分类体系中归入肿瘤 / 脑肿瘤类别。数据集的主题标签为 Genomics,说明其内容定位于基因组学或更广义的组学层面。数据集来源于 omicsdi.org,该来源站为组学数据的汇集与索引平台,本数据集即通过该渠道被收录并呈现。就背景而言,该数据集的出现为脑干胶质瘤的转录组研究提供了一个具体的数据实例,其英文名称标识为 782a0a9a-a024-4aa4-b2a6-3ed0312cdcb6 - samples,这一名称可用于在相关数据环境中对该数据集进行唯一识别与检索。

【数据内容】

该数据集的内容为 RNAseq 数据,测序对象是脑干胶质瘤原发肿瘤样本。RNAseq 即 RNA 测序,用于检测样本中的 RNA 分子,通常反映基因转录层面的信息。该数据集明确标注为原发肿瘤样本,意味着其取材对象为肿瘤原发灶,而非转移灶或细胞系等其它材料。测序平台为 Illumina HiSeq X Ten,这是高通量测序中常见的一类平台。除上述信息外,关于样本数量、测序读长、覆盖深度、数据文件格式与体积等具体内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org。源站描述指出,该数据是对脑干胶质瘤原发肿瘤样本在 Illumina HiSeq X Ten 平台上进行 RNAseq 所获得的结果。数据集的英文名称为 782a0a9a-a024-4aa4-b2a6-3ed0312cdcb6 - samples。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、受试者人口学特征以及具体实验流程等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其脑干胶质瘤原发肿瘤样本 RNAseq 的属性,该数据集可适用于脑肿瘤尤其是脑干胶质瘤相关的转录组分析场景,例如基因表达谱的观察、转录本层面的比较研究,以及在基因组学主题下开展的探索性分析。由于主题标签为 Genomics,该数据集也可用于组学数据整合、跨数据集检索与元分析等用途。此外,在肿瘤 / 脑肿瘤分类框架下,该数据集可作为脑肿瘤分子数据资源的一部分,用于方法验证、流程测试或教学演示等场景。关于该数据集是否已被用于特定疾病分型、预后判断或靶点发现等具体应用,源站未提供。

【使用方法】

该数据集为 RNAseq 数据,使用时应遵循 RNA 测序数据的常规处理思路,包括序列质控、比对或定量、表达矩阵构建以及后续的差异分析或功能分析等。由于测序平台为 Illumina HiSeq X Ten,处理流程需与该平台产出的数据格式相适配。数据集名称中包含 samples 字样,提示其可能以样本为单位组织数据。关于具体的下载方式、文件目录结构、参考基因组版本、分析流程参数以及是否附带预处理结果,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集明确标注为脑干胶质瘤原发肿瘤样本的 RNAseq 数据,测序平台为 Illumina HiSeq X Ten,来源为 omicsdi.org。就限制而言,当前可确认的信息仅限于数据类型、样本类型、测序平台、来源与分类标签,关于样本量、生物学重复、测序质量指标、批次信息以及数据完整性等均无具体说明,源站未提供。因此在使用该数据集时,应注意到其元数据层面的信息有限,无法据此对数据质量作出全面评估。此外,该数据集仅涉及脑干胶质瘤原发肿瘤样本,是否涵盖正常对照或其它亚型,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 omicsdi.org,英文名称为 782a0a9a-a024-4aa4-b2a6-3ed0312cdcb6 - samples。关于该数据集的引用方式、原始发表文献、数据许可协议、使用条款以及是否允许再分发等,源站未提供。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001006094

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

RNAseq on Illumina HiSeq X Ten of brainstem glioma primary tumor sample

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