527894_dataset - samples:DIPG 驱动突变时空同质性研究全外显子测序样本
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤 / 脑肿瘤方向,主题标签为 Genomics。数据可用于研究弥漫性内生性脑桥胶质瘤驱动突变的空间与时间同质性,支持基因组层面的突变分析、样本分组与特征分类等任务(来源 omicsdi.org)

基本信息
资源简介
527894_dataset - samples:DIPG 驱动突变时空同质性研究全外显子测序样本
527894_dataset - samples 是一个面向肿瘤研究、特别是脑肿瘤方向的基因组学数据集,收录于 omicsdi.org。该数据集围绕弥漫性内生性脑桥胶质瘤(DIPG)展开,包含来自 9 位患者的 70 例全外显子测序数据,服务于“Spatial and Temporal Homogeneity of Driver Mutations in Diffuse Intrinsic Pointine Glioma”这一项目。其主题标签为 Genomics,整体定位属于肿瘤 / 脑肿瘤分类。该数据集可用于研究 DIPG 驱动突变在空间与时间维度上的同质性,并为基因组层面的突变分析、样本分组与特征分类等任务提供数据支持。整体而言,它是一份聚焦于脑肿瘤基因组变异特征、具有明确项目背景的测序样本集合。
【数据集背景】
该数据集所属项目聚焦于弥漫性内生性脑桥胶质瘤(DIPG)中驱动突变的空间与时间同质性。DIPG 属于脑肿瘤范畴,本站分类将其归入肿瘤 / 脑肿瘤方向。数据集英文名为 527894_dataset - samples,来源站为 omicsdi.org,主题标签为 Genomics。项目名称明确指向对 DIPG 驱动突变在空间和时间两个维度上是否保持同质这一问题的探索,因此该数据集在背景上具有明确的疾病指向和基因组学研究指向。
【数据内容】
该数据集包含 70 例全外显子测序数据,来自 9 位 DIPG 患者。数据主题标签为 Genomics,属于基因组学层面的测序数据。全外显子测序通常用于捕获蛋白编码区域的变异信息,因此该数据集可用于围绕驱动突变开展分析。数据内容与“Spatial and Temporal Homogeneity of Driver Mutations in Diffuse Intrinsic Pointine Glioma”项目直接相关,样本数量为 70,患者数量为 9。除上述信息外,源站未提供更细粒度的数据字段、文件格式、变异类型或临床注释信息。
【采集与来源】
该数据集来源站为 omicsdi.org。根据源站描述,其内容为来自 9 位 DIPG 患者的 70 例全外显子测序数据,服务于上述 DIPG 驱动突变空间与时间同质性项目。本站分类为肿瘤 / 脑肿瘤,主题标签为 Genomics。除来源站和源站描述所提供的信息外,关于样本采集地点、采集时间、测序平台、建库方法、伦理审批信息等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于研究弥漫性内生性脑桥胶质瘤驱动突变的空间与时间同质性,支持基因组层面的突变分析、样本分组与特征分类等任务。由于其属于肿瘤 / 脑肿瘤方向且主题标签为 Genomics,适合用于脑肿瘤基因组变异特征的探索性分析,也可用于围绕 DIPG 样本开展分组比较或特征分类研究。其 70 例测序数据与 9 位患者的对应关系,为在样本层面开展分组与特征分析提供了基础。除上述适用方向外,源站未提供其他具体应用场景。
【使用方法】
该数据集来源于 omicsdi.org,可通过该来源站获取相关数据入口。使用时可围绕全外显子测序数据开展基因组层面的突变分析、样本分组与特征分类等任务。由于数据涉及 9 位患者的 70 例样本,使用中可依据样本与患者的对应关系进行组织与分析。关于具体的下载方式、文件组织格式、分析流程、软件工具与参数设置,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集包含 70 例全外显子测序数据,来自 9 位患者,样本量与患者数已在源站描述中给出。其项目背景明确指向 DIPG 驱动突变的空间与时间同质性研究。关于数据质量指标、测序深度、覆盖度、变异检出灵敏度、批次效应、样本重复性、临床信息完整性等,源站未提供。因此,在使用该数据集时,应仅依据已知的样本数量、患者数量、测序类型与项目背景进行判断,其他质量维度需以源站实际提供的信息为准。
【引用与许可】
该数据集来源站为 omicsdi.org,源站描述中提及项目名称为“Spatial and Temporal Homogeneity of Driver Mutations in Diffuse Intrinsic Pointine Glioma”。关于引用格式、许可协议、使用条款、数据共享政策与授权范围,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001002111
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
70 来自9名DIPG患者的全外显子测序,用于项目《弥漫性内生性脑桥胶质瘤驱动突变的空间和时间同质性》
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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