中国人群46例原发性恶性胶质瘤队列

该数据集来自omicsdi.org,收录46例中国原发性恶性胶质瘤患者,全部接受全外显子测序(WES),其中27例另做RNA-seq

omicsdi
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基因组分类Genomics
46 patients primary malignant glioma cohort in Chinese population

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-22

资源简介

中国人群46例原发性恶性胶质瘤队列

该数据集收录了46例中国原发性恶性胶质瘤患者,全部患者均接受了全外显子测序(WES)分析,其中27例患者另外进行了RNA-seq分析。数据集来源于omicsdi.org,归类于肿瘤/脑肿瘤方向,主题标签为基因组学。研究者对不同WHO分级患者之间的分子特征进行了比较,并以六个月无进展生存(PFS6)状态将胶质母细胞瘤(GBM)患者分为生存较好与生存较差两组,比较两组的基因组图谱。该数据集为研究中国人群原发性恶性胶质瘤的基因组特征及与生存相关的分子差异提供了样本基础。

【数据集背景】

胶质瘤是中枢神经系统常见的恶性肿瘤,其中原发性恶性胶质瘤在临床预后上存在明显异质性。该数据集聚焦中国人群的原发性恶性胶质瘤患者队列,旨在从基因组层面刻画不同WHO分级肿瘤之间的分子特征差异,并进一步探讨胶质母细胞瘤患者中与生存相关的基因组图谱特征。数据集以中国患者为研究对象,对于理解该人群胶质瘤的分子流行病学特征具有参考价值。

【数据内容】

数据集包含46例中国原发性恶性胶质瘤患者,全部患者均具有全外显子测序(WES)数据;其中27例患者同时具有RNA-seq数据。基于这些数据,研究者开展了不同WHO分级患者间分子特征的比较分析,并依据六个月无进展生存(PFS6)状态将胶质母细胞瘤患者划分为生存较好组与生存较差组,对两组的基因组图谱进行比较。数据集的主题标签为基因组学,所属分类为肿瘤/脑肿瘤。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。研究对象为46例中国原发性恶性胶质瘤患者,全部接受全外显子测序,其中27例接受RNA-seq分析。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批及具体测序平台等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于胶质瘤基因组学研究,尤其是针对中国人群原发性恶性胶质瘤的分子特征分析。可用于比较不同WHO分级肿瘤之间的基因组差异,也可用于胶质母细胞瘤患者中基于PFS6状态的生存相关基因组图谱分析。此外,对于同时具有WES与RNA-seq数据的27例患者,可支持基因组变异与转录组特征相结合的分析探索。具体分析设计需结合源站提供的原始数据与说明进行。

【使用方法】

使用该数据集时,可依据全外显子测序数据开展体细胞突变、拷贝数变异等基因组层面的分析,并按照WHO分级进行分组比较;对于具有RNA-seq数据的27例患者,可结合转录组信息进行表达层面的分析。针对胶质母细胞瘤患者,可按照PFS6状态分为生存较好与生存较差两组,比较两组间的基因组图谱差异。关于数据下载方式、文件格式及具体分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集样本量为46例,其中RNA-seq数据仅覆盖27例,样本规模相对有限,可能影响统计效能与结果的推广性。数据集仅涉及中国人群原发性恶性胶质瘤患者,结论外推至其他人群时需谨慎。关于测序深度、数据质控指标、缺失值情况以及随访信息等,源站未提供。使用时应结合源站说明评估数据质量与适用范围。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与许可条款,源站未提供。使用者在引用或再分发数据前,应查阅omicsdi.org上的相关说明并遵循其要求。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001005583

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们招募了46例中国原发性恶性胶质瘤患者。所有患者均接受了全外显子组测序(WES)分析,其中27例还接受了RNA-seq分析。我们比较了不同WHO级别患者的分子特征。我们采用六个月无进展生存期(PFS6)状态将胶质母细胞瘤(GBM)患者分为生存良好组和生存不良组,并比较了两组的基因组图谱。

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