人脑肿瘤Nanopore低覆盖全基因组测序样本
该数据集来源于omicsdi.org,收录了人脑肿瘤的Nanopore低覆盖全基因组测序(low-pass WGS)样本,用于评估基于DNA甲基化的癌症分类方法

基本信息
资源简介
人脑肿瘤Nanopore低覆盖全基因组测序样本
该数据集收录于人脑肿瘤研究相关资源中,英文名称为“15d88cc9-610e-4674-a382-cf3f81618247 - samples”,在分类上归属于肿瘤领域下的脑肿瘤方向,来源站为omicsdi.org。根据源站描述,该数据集围绕人脑肿瘤的Nanopore低覆盖全基因组测序(low-pass WGS)样本展开,核心目的在于评估基于DNA甲基化的癌症分类方法。主题标签为Genomics,短描述进一步说明其收录的是人脑肿瘤的Nanopore低覆盖全基因组测序样本,用于评估基于DNA甲基化的癌症分类。整体来看,该数据集面向脑肿瘤的基因组学与表观遗传学分类研究,为相关方法学评估提供样本层面的数据支撑。
【数据集背景】
该数据集来源于omicsdi.org,所属分类为肿瘤 / 脑肿瘤,主题标签为Genomics。源站描述明确指出,其背景是围绕人脑肿瘤开展Nanopore低覆盖全基因组测序,并以此评估基于DNA甲基化的癌症分类方法。基于DNA甲基化的分类思路在肿瘤研究中具有方法学意义,而该数据集正是为这一评估目的而组织的人脑肿瘤样本集合。关于该数据集更具体的项目背景、研究机构、资助来源等信息,源站未提供。
【数据内容】
该数据集收录的是人脑肿瘤的Nanopore低覆盖全基因组测序(low-pass WGS)样本。其英文名称中包含“samples”字样,表明数据以样本为组织单位。数据主题标签为Genomics,说明其内容属于基因组学范畴。结合源站描述,这些样本用于评估基于DNA甲基化的癌症分类方法,因此数据内容与脑肿瘤样本的测序信息及甲基化分类评估相关。关于样本数量、具体肿瘤类型分布、测序深度、数据文件格式与大小等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为omicsdi.org。其采集方式为对人脑肿瘤进行Nanopore低覆盖全基因组测序(low-pass WGS)。源站描述中明确提及“Nanopore low-pass WGS”,说明测序平台为Nanopore,测序策略为低覆盖全基因组测序。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体实验流程与建库方法等,源站未提供。
【适用场景】
根据源站描述,该数据集的核心适用场景是评估基于DNA甲基化的癌症分类方法,且研究对象为人脑肿瘤。因此,它可用于脑肿瘤相关的DNA甲基化分类方法学评估工作。其主题标签为Genomics,也表明其适用于基因组学相关的研究场景。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以样本形式组织,英文名称中包含“samples”。关于如何下载、访问、解析或使用该数据集的具体步骤、工具与流程,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集采用Nanopore低覆盖全基因组测序(low-pass WGS),这一测序策略本身具有覆盖度较低的特点。关于该数据集的数据质量指标、覆盖度具体数值、样本质量评估结果、批次效应、潜在偏差以及使用时的注意事项等,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款与版权信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001009663
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Nanopore low-pass WGS of human brain tumors for evaluation of DNA methylation-based classification of cancer
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




