儿童脑肿瘤 Hi-C 样本数据集

资源简介

儿童脑肿瘤 Hi-C 样本数据集

该数据集收录了来源于多种儿童脑肿瘤的 Hi-C 数据，共 72 例样本，原始数据以 FASTQ 格式提供，测序平台为 Illumina HiSeq2500。所覆盖的肿瘤类型较为多样，包括室管膜瘤（PFA、PFB、Ste、spinal 亚型）、髓母细胞瘤（G3、G4、SHH 亚型）、高级别胶质瘤（H3K27 与 H3-WT）、毛细胞星形细胞瘤等。数据集在站内被归类于肿瘤 / 脑肿瘤方向，主题标签为 Genomics，来源站为 omicsdi.org。整体而言，该数据集面向儿童脑肿瘤的三维基因组构象研究，为探索不同亚型肿瘤染色质空间组织特征提供了原始测序数据基础。

【数据集背景】

儿童脑肿瘤是一组在分子特征和临床行为上高度异质的恶性肿瘤，不同亚型之间在驱动基因、表观遗传修饰和染色质结构层面存在显著差异。Hi-C 技术能够在全基因组范围内捕获染色质的三维空间互作信息，从而揭示拓扑关联结构域、区室化等高级结构特征。该数据集正是围绕这一技术路线，针对多种儿童脑肿瘤类型构建的 Hi-C 数据集合，旨在为相关基础研究与分子分型研究提供原始数据支撑。数据集来源站为 omicsdi.org，站内分类为肿瘤 / 脑肿瘤，主题标签为 Genomics。

【数据内容】

该数据集包含 72 例 Hi-C 样本（n=72），覆盖的肿瘤类型包括：室管膜瘤，具体涉及 PFA、PFB、Ste、spinal 等亚型；髓母细胞瘤，具体涉及 G3、G4、SHH 等亚型；高级别胶质瘤，具体涉及 H3K27 与 H3-WT；以及毛细胞星形细胞瘤等。原始数据以 FASTQ 格式提供。除上述内容外，源站未提供关于数据文件数量、总数据量、分辨率水平、重复次数等更细粒度的描述。

【采集与来源】

该数据集的测序数据在 Illumina HiSeq2500 平台上生成，原始数据以 FASTQ 格式交付。数据来源站为 omicsdi.org。关于样本采集的具体机构、伦理审批信息、患者人口学特征、采样时间与地点等，源站未提供。

【适用场景】

基于其数据类型与覆盖范围，该数据集可用于儿童脑肿瘤三维基因组结构相关的研究场景，例如比较不同肿瘤亚型之间染色质空间组织的差异、分析特定亚型（如室管膜瘤 PFA/PFB、髓母细胞瘤 G3/G4/SHH、高级别胶质瘤 H3K27/H3-WT）的 Hi-C 互作特征，以及作为染色质构象分析的原始数据输入。此外，也可用于方法学层面的数据再处理与流程验证。关于该数据集是否已被用于特定研究或是否与某些临床终点相关联，源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 FASTQ 格式提供原始测序数据，使用时可按照 Hi-C 数据处理的常规流程进行后续分析，包括比对、过滤、互作矩阵构建及结构特征提取等。由于源站未提供配套的处理流程说明、参考基因组版本或标准化参数，具体分析步骤需使用者根据自身研究需求自行确定。关于是否提供预处理后的中间文件或可视化结果，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集共包含 72 例样本，测序平台为 Illumina HiSeq2500，原始数据以 FASTQ 格式提供。关于数据质量评分、测序深度、有效互作比例、样本纳入与排除标准、批次效应控制等信息，源站未提供。使用者在使用时需注意，该数据集覆盖的肿瘤类型虽较为多样，但各亚型的样本数量分布、是否均衡等信息源站未提供，可能影响亚型间比较的统计效力。此外，该数据集不包含临床注释或随访信息，源站未提供相关说明。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、文献出处、DOI、许可协议及使用限制等，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前，应自行核实来源站 omicsdi.org 上的相关说明与原始数据提供方的要求。