UCSF-BMSR MRI数据集
UCSF-BMSR MRI数据集是一个临床多模态脑部MRI数据集，包含来自412名患者的560个脑部MRI图像，涵盖T1后对比、T1前对比、FLAIR和减影等模态，并提供了5136个脑转移瘤的专家标注和体素级分割，主要用于推动基于人工智能的脑转移瘤检测研究，特别是在小转移瘤识别方面。
基本信息
资源简介
UCSF-BMSR MRI数据集
【一句话概览】
加州大学旧金山分校脑转移立体定向放射外科（UCSF-BMSR）数据集是一个公开的临床多模态脑部MRI数据集，包含412名患者的560例脑部MRI，并由专家标注了5136个脑转移灶。数据包括配准并去颅骨的T1增强、T1平扫、FLAIR及减影图像，以及以NifTI格式提供的增强脑转移灶体素级分割，还包含患者人口统计学、手术状态和原发癌症类型。目前461例检查可在UCSF智能成像中心网站下载，其余数据将在2024年MICCAI/BraTS挑战赛之后开放（来源 imagingdatasets.ucsf.edu）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《The University of California San Francisco Brain Metastases Stereotactic Radiosurgery (UCSF-BMSR) MRI Dataset》。
【数据内容】
源站原始描述：The University of California San Francisco Brain Metastases Stereotactic Radiosurgery (UCSF-BMSR) dataset is a public, clinical, multimodal brain MRI dataset consisting of 560 brain MRIs from 412 patients with expert annotations of 5136 brain metastases. Data consists of registered and skull stripped T1 post-contrast, T1 pre-contrast, FLAIR and subtraction (T1 pre-contrast - T1 post-contrast) images and voxelwise segmentations of enhancing brain metastases in NifTI format. The dataset also inclu…
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：加州大学旧金山分校脑转移瘤立体定向放射外科（UCSF-BMSR）数据集是一个公开的临床多模态脑部MRI数据集，包含来自412名患者的560例脑部MRI，由专家标注了5136个脑转移瘤。数据包括配准和去颅骨的T1增强后、T1增强前、FLAIR及减影（T1增强前 - T1增强后）图像，以及以NifTI格式提供的增强脑转移瘤体素级分割。该数据集还包括患者人口统计学信息、手术状态和原发癌症类型。目前，UCSF智能成像中心网站提供461例检查可供下载。其余数据将在2024年MICCAI/BraTS挑战赛之后开放。UCSF-BSMR已公开，希望研究人员能利用这些数据推动脑转移瘤AI应用的边界。
【主题与分类】
主题标签：brain metastases、MRI、neuroimaging、segmentation、stereotactic radiosurgery、multimodal、NifTI、oncology。
【获取与许可】
源站页面：https://imagingdatasets.ucsf.edu/dataset/1
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://imagingdatasets.ucsf.edu/dataset/1
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
UCSF-BMSR MRI数据集是由加州大学旧金山分校创建并公开的临床多模态脑部MRI数据集，包含560个来自412名患者的脑部MRI图像，其中专家标注了5136个脑转移瘤。数据集包括经过注册和颅骨剥离处理的T1后对比、T1前对比、FLAIR和减影图像，以及增强脑转移瘤的体素级分割，数据格式为NifTI。此外，还提供了患者人口统计信息、手术状态和原发癌类型等临床数据。该数据集旨在推动基于人工智能的脑转移瘤研究，特别是在小转移瘤检测方面的应用。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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