乳腺癌骨转移预测表达数据集
肿瘤领域表格公开数据集，来源：ncbi。
基本信息
资源简介
乳腺癌骨转移预测表达数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《MDA-MB-231 metastasis to human bone》。源站首次发布：Sep 23 201。
【数据内容】
源站原始描述：MDA-MB-231 human breast cancer cells were injected orthotopiclly into mammary glands 4 of female NOD SCID mice 4-weeks after sub-cutaneous implantation of human femoral bone chips. Primary tumour, bone chips containing metastatic deposits and naive bone chips were isolated and mRNA analysed for gene expression to determine genetic signitures associated with breast cancer bone metastasis
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL570、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE137842
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 07 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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暂未开放公开下载
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE137842
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
GSE137842常用于乳腺癌骨转移相关基因表达分析，包含骨转移与非骨转移相关样本。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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