AATF沉默对BIU-87基因表达的影响[RNA-seq]
该数据集来自NCBI GEO，标题为AATF沉默对BIU-87基因表达的影响[RNA-seq]，属于肿瘤/膀胱癌分类。数据通过高通量测序比较AATF沉默的BIU-87细胞与对照组的基因表达谱，鉴定差异表达基因
![GSE248071: Effect of AATF silencing on gene expression of BIU-87 [RNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/163775.jpg)
基本信息
资源简介
AATF沉默对BIU-87基因表达的影响[RNA-seq]
GSE248071 数据集来自 NCBI GEO，标题为“Effect of AATF silencing on gene expression of BIU-87 [RNA-seq]”，即 AATF 沉默对 BIU-87 细胞基因表达影响的 RNA 测序研究。该数据集属于肿瘤/膀胱癌分类，通过高通量测序比较 AATF 沉默的 BIU-87 细胞与对照组的基因表达谱，以鉴定差异表达基因。数据集包含 1 个文件，样例文件为 GSE248071_series_matrix.txt.gz，作者为 Shutao，Tan，发布时间为 Nov 17 202。该数据集为研究 AATF 在膀胱癌细胞中的表达调控作用提供了转录组层面的表达谱资料。
【数据集背景】
该数据集聚焦于膀胱癌相关细胞系 BIU-87 中 AATF 基因沉默后的基因表达变化。源站描述指出，研究通过比较 AATF 沉默的 BIU-87 细胞与对照组的基因表达谱来鉴定差异表达基因，结果可为揭示 AATF 沉默对 BIU-87 的影响提供重要信息。数据集标题明确其技术路线为 RNA-seq，主题标签包含“Expression profiling by high throughput sequencing”，表明其属于基于高通量测序的表达谱研究。该数据集归入肿瘤/膀胱癌分类，适合在膀胱癌分子机制研究的背景下理解其用途。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE248071_series_matrix.txt.gz，采用 GZIP 压缩格式。源站描述表明，数据内容的核心是比较 AATF 沉默组与对照组 BIU-87 细胞的基因表达谱，并据此鉴定差异表达基因。主题标签中列出了 GPL24676 与 9606，分别对应平台与物种标识信息。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、分组细节、测序深度、差异基因数量或具体基因列表的进一步说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI GEO（ncbi.nlm.nih.gov），源站标题为“Effect of AATF silencing on gene expression of BIU-87 [RNA-seq]”。作者为 Shutao，Tan，发布时间为 Nov 17 202。数据通过高通量测序获取 BIU-87 细胞在 AATF 沉默与对照条件下的基因表达谱。关于具体的细胞培养条件、沉默方法、测序平台型号、建库策略及测序读长等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于膀胱癌相关研究中 AATF 基因功能与表达调控的分析场景，例如比较 AATF 沉默前后 BIU-87 细胞的转录组差异、筛选差异表达基因，以及为后续实验验证提供候选基因线索。其表达谱数据也可用于与其它膀胱癌转录组数据集的对照分析或方法学参考。由于数据集仅涉及 BIU-87 细胞系，适用场景应限定于该细胞模型下的表达谱研究，不宜直接外推至临床样本或其它细胞模型。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE248071_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。分析时可围绕 AATF 沉默组与对照组的表达谱比较展开，鉴定差异表达基因。关于具体的标准化方法、差异分析阈值及统计模型，源站未提供，需依据数据实际内容自行确定。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件，数据规模有限；源站未提供样本数量、重复设置、测序质量指标及差异分析参数等信息，难以据此评估数据的统计稳健性。数据集基于 BIU-87 细胞系的 RNA-seq 表达谱，结论受细胞模型与实验条件限制。此外，发布时间标注为“Nov 17 202”，年份信息不完整。除源站描述外，未提供额外的质量控制说明。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Shutao，Tan，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用方式、许可协议及使用限制，源站未提供。使用时应遵循 NCBI GEO 的通用数据使用规范，并建议在相关研究中注明数据集编号 GSE248071 及源站标题。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE248071
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
通过比较AATF沉默的BIU-87细胞与对照组的基因表达谱，鉴定出差异表达基因。这些结果为揭示AATF沉默对BIU-87的影响提供了重要信息。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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