EBV感染的BJAB-B1转录组DMS探测与测序数据集
该数据集来自NCBI GEO，标题为EBV感染的BJAB-B1转录组DMS探测与测序，属于肿瘤/B细胞淋巴瘤分类。可用于研究EBV感染背景下B细胞淋巴瘤转录组的RNA二级结构特征，支撑RNA结构预测与相关分析（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
EBV感染的BJAB-B1转录组DMS探测与测序数据集
GSE210478 数据集来自 NCBI GEO，标题为“DMS probing of and sequencing of the EBV infected BJAB-B1 transcriptome”，即对 EBV 感染的 BJAB-B1 转录组进行 DMS 探测与测序。该数据集在本站归入肿瘤 / B细胞淋巴瘤分类，由 Collin A O'Leary 提交，发布时间为 Aug 03 202（源站所记日期）。其核心目标是在细胞环境下获取实验来源的 RNA 结构信息，为研究 EBV 感染背景下 B 细胞淋巴瘤转录组的 RNA 二级结构特征提供数据基础，可支撑 RNA 结构预测与相关分析。数据集仅包含 1 个文件，样例为 GSE210478_series_matrix.txt.gz，以 GZIP 压缩格式分发。
【数据集背景】
该数据集关注 EBV 感染与 B 细胞淋巴瘤相关转录组的 RNA 结构问题。源站描述指出，其目的是在细胞环境中（in cellulo）获得实验推导的 RNA 结构信息，探测对象为 EBV 感染的 BJAB-B1 转录组。DMS 探测与测序相结合，是获取 RNA 二级结构信息的常用实验策略；本数据集即围绕这一策略产生，主题标签中包含 Other、GPL21290 与 9606，其中 9606 对应人类物种标识，GPL21290 为平台标识。
【数据内容】
数据集的文件数量为 1，文件样例为 GSE210478_series_matrix.txt.gz，属于 GZIP 压缩包。该文件为系列矩阵文件，通常用于汇总样本层面的表达或探测信号信息。数据集标题与源站描述表明，其内容与 EBV 感染的 BJAB-B1 转录组的 DMS 探测和测序相关。关于矩阵中具体包含哪些字段、样本数量、探针或转录本注释细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI GEO 数据库收录的数据集。作者为 Collin A O'Leary，发布时间记为 Aug 03 202。源站描述说明，数据采集旨在获得细胞环境内实验推导的 BJAB-B1 转录组 RNA 结构信息。关于具体的细胞培养条件、DMS 处理浓度与时间、测序平台型号、测序深度及生物学重复数量等实验细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于研究 EBV 感染背景下 B 细胞淋巴瘤转录组的 RNA 二级结构特征，支撑 RNA 结构预测与相关分析。结合其肿瘤 / B细胞淋巴瘤分类，适合作为 B 细胞淋巴瘤与 EBV 感染相关 RNA 结构研究的参考数据。由于主题标签包含人类物种标识，也可用于人类转录组范围内的结构信息比较分析。关于该数据是否适用于其他疾病模型或跨物种比较，源站未提供。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE210478_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入，以避免因字段含义或编码不一致导致的分析偏差。关于具体的读取工具、预处理步骤与归一化方法，源站未提供。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件，文件样例为系列矩阵文件，未提供原始测序数据或其他辅助文件的说明。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应及技术偏差等信息，源站未提供。使用时应注意，DMS 探测获得的是实验推导的结构信息，其覆盖范围与分辨率受实验设计影响，而相关实验细节源站未提供，因此难以据此判断数据的具体适用边界。
【引用与许可】
数据集作者为 Collin A O'Leary，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的正式引用文献、使用许可条款及再分发限制，源站未提供。使用者在引用或再利用前，应自行查阅源站页面以确认最新的引用要求与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE210478
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
To gain in cellulo, experimentally derived RNA structural information within the BJAB-B1 transcriptome
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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