GSE135800:MYCi975调控MYC靶基因

该数据可用于研究MYC靶基因表达变化及药物调控机制,支持基因表达预测等分析任务(来源 NCBI)。源站首次发布:Aug 13 201

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基因组预测GPL203019606
GSE135800: MYCi975 regulates MYC target genes

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

GSE135800:MYCi975调控MYC靶基因

GSE135800 是一个围绕 MYC 靶基因调控机制展开的基因表达谱数据集,英文标题为“MYCi975 regulates MYC target genes”,在 NCBI 来源站以“MYCi975 regulates MYC target genes”为题发布。该数据集通过高通量测序(RNA-seq)方式,记录 MYCi975 对 PC3 与 P493-6 细胞中 MYC 靶基因的调控情况,属于肿瘤 / B 细胞淋巴瘤相关研究方向。数据集由 Sarki、Abdulkadir 提交,首次发布时间为 Aug 13 201,包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE135800_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据可用于观察 MYC 靶基因在药物干预下的表达变化,为理解 MYC 相关转录调控与药物作用机制提供表达层面的数据基础。

【数据集背景】

MYC 是重要的转录调控因子,其靶基因表达变化与肿瘤发生发展密切相关。GSE135800 聚焦 MYCi975 这一处理因素对 MYC 靶基因的调控作用,研究场景涉及 PC3 与 P493-6 两类细胞,分类上归入肿瘤 / B 细胞淋巴瘤方向。该数据集的主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL20301 与 9606,表明其采用高通量测序进行表达谱分析,并涉及人类样本平台信息。源站描述指出,该研究通过深度测序(RNA-seq)报告 MYCi975 在 PC3 和 P493-6 细胞中对 MYC 靶基因的调控。

【数据内容】

该数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE135800_series_matrix.txt.gz,属于系列矩阵形式的表达数据文件。主题标签中的 Expression profiling by high throughput sequencing 说明数据来自高通量测序的表达谱检测;GPL20301 与 9606 分别对应平台与物种相关信息。数据内容围绕 MYCi975 处理条件下 MYC 靶基因的表达变化展开,可用于比较药物调控前后靶基因的表达差异。除上述信息外,源站未提供更细化的样本数量、分组设计或基因数量等说明。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“MYCi975 regulates MYC target genes”。源站描述说明,研究通过深度测序(RNA-seq)在 PC3 与 P493-6 细胞中报告 MYCi975 对 MYC 靶基因的调控。数据集作者为 Sarki、Abdulkadir,首次发布时间为 Aug 13 201。数据以 GSE135800_series_matrix.txt.gz 形式提供下载。关于具体测序平台型号、建库方法、测序深度与样本处理细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据可用于研究 MYC 靶基因表达变化及药物调控机制,支持基因表达预测等分析任务(来源 NCBI)。在肿瘤 / B 细胞淋巴瘤相关研究中,可借助该表达谱数据观察 MYCi975 干预下 MYC 靶基因的表达模式,进而用于差异表达分析、调控关系探讨以及药物作用机制的初步研究。由于数据涉及 PC3 与 P493-6 细胞,适合围绕这两类细胞背景下的 MYC 靶基因调控开展分析。其他更具体的应用方向源站未提供。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE135800_series_matrix.txt.gz,按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入分析流程。由于该文件为系列矩阵形式,读取后应结合主题标签中的平台与物种信息理解数据组织方式。关于具体的预处理步骤、归一化方法与分析参数,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件,数据规模与样本组成信息有限,源站未提供样本数量、重复设置、测序质量指标或质控结果等细节。使用时应注意数据仅覆盖 PC3 与 P493-6 细胞中 MYCi975 对 MYC 靶基因的调控信息,结论外推需谨慎。发布时间记为 Aug 13 201,年份信息不完整,引用时应以源站记录为准。其他质量评估信息源站未提供。

【引用与许可】

数据集作者为 Sarki、Abdulkadir,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“MYCi975 regulates MYC target genes”。引用时应注明数据集编号 GSE135800 及上述来源信息。关于许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE135800

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

We report MYCi975 regulates MYC taraget genes in PC3 and P493-6 cells by deep sequencing (RNA-seq).

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