ena数据集
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤 / B细胞淋巴瘤分类，主题标签为 Genomics。数据涉及在 BL 细胞系中对新型 miRs nmiR-1 和 nmiR-2 进行过表达和敲低实验，其中 nmiR-1 使用 SU-DHL4 细胞系，nmiR-2 使用 Raji 细胞系，并包含所有细胞
基本信息
资源简介
ena数据集
ena-DATASET-DKFZ-IBIOS-16-09-2015-13:05:30:578-414 - samples 是一个收录于 omicsdi.org 的肿瘤相关数据集，分类归属为 B细胞淋巴瘤，主题标签为 Genomics。该数据集围绕 Burkitt 淋巴瘤（BL）细胞系中两种新型微小 RNA——nmiR-1 与 nmiR-2 的功能研究展开。研究者分别对这两种新型 miRs 进行了过表达和敲低处理，其中 nmiR-1 的实验在 SU-DHL4 细胞系中进行，nmiR-2 的实验在 Raji 细胞系中进行，并对所有细胞系设置了 Mock 对照。随后通过常规 RNA-Seq 技术，旨在识别这些新型 miRs 直接和间接调控的下游 mRNA 靶标。整体而言，该数据集提供了在 B细胞淋巴瘤背景下研究非编码 RNA 调控网络的转录组学资源。
【数据集背景】
该数据集所属分类为肿瘤 / B细胞淋巴瘤，主题标签为 Genomics，来源站为 omicsdi.org。其研究背景聚焦于 Burkitt 淋巴瘤（BL）细胞系中两种此前未被充分描述的新型微小 RNA，即 nmiR-1 和 nmiR-2。为探究这两种新型 miRs 在 BL 细胞中的功能角色，研究者设计了对二者分别进行过表达和敲低的实验策略，并结合常规 RNA-Seq 来系统识别其下游的 mRNA 靶标。这一背景信息来自源站描述，反映了该数据集在非编码 RNA 与 B细胞淋巴瘤分子机制研究中的定位。
【数据内容】
数据集的核心内容是在 BL 细胞系中对 nmiR-1 和 nmiR-2 进行过表达与敲低后获得的 RNA-Seq 数据。具体而言，nmiR-1 的过表达和敲低实验在 SU-DHL4 细胞系中完成，nmiR-2 的过表达和敲低实验在 Raji 细胞系中完成。此外，实验还包含了所有细胞系的 Mock 对照，以便在比较中排除非特异性影响。RNA-Seq 的目的在于识别这两种新型 miRs 直接和间接的下游 mRNA 靶标。数据集名称中包含“samples”字样，表明其以样本形式组织。关于样本的具体数量、测序深度、读长、文件格式等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org，英文名称为 ena-DATASET-DKFZ-IBIOS-16-09-2015-13:05:30:578-414 - samples。从名称中的“ena”与“DKFZ-IBIOS”等信息可以了解其与欧洲核苷酸档案及德国癌症研究中心相关研究单元的关联，但源站描述中并未进一步说明采集的具体实验流程、建库方法、测序平台或数据处理管线。关于样本采集时间、地点、操作人员及伦理审批等信息，源站未提供。
【适用场景】
基于源站描述，该数据集适用于研究 B细胞淋巴瘤中新型微小 RNA 的调控功能，尤其是 nmiR-1 和 nmiR-2 在 BL 细胞系中对下游 mRNA 靶标的直接与间接影响。潜在应用包括：分析过表达与敲低条件下转录组差异，推断 miRNA-mRNA 调控关系，以及将 SU-DHL4 与 Raji 细胞系中的结果进行比较研究。由于主题标签为 Genomics，该数据集也可用于转录组学层面的整合分析。关于是否适用于临床诊断、预后预测或其他特定应用，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以样本形式提供，用户可通过 omicsdi.org 获取。使用时可结合过表达、敲低与 Mock 对照样本进行差异表达分析，以识别受 nmiR-1 或 nmiR-2 调控的 mRNA 靶标。由于 nmiR-1 与 nmiR-2 分别在不同细胞系中研究，分析时需注意细胞系背景差异。关于具体的下载方式、数据格式、分析工具推荐及预处理步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集包含 Mock 对照，有助于控制实验背景，这是其设计上的一个优点。然而，关于测序质量、重复次数、批次效应、数据完整性及验证实验等信息，源站未提供。此外，由于 nmiR-1 和 nmiR-2 分别仅在 SU-DHL4 和 Raji 一种细胞系中研究，结论的普适性可能受到限制。关于数据是否存在污染、偏差或其他质量问题的说明，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款及版权信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001001612
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在BL细胞系中（nmiR-1使用SU-DHL4，nmiR-2使用Raji）对所述两种新型miR（nmiR-1和nmiR-2）进行过表达和敲低后，我们进行了常规RNA-Seq（包括所有细胞系的Mock对照），以鉴定其直接和间接的下游mRNA靶标。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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