人源GluN1-2B与Fab 007-168复合物结构

该数据集包含通过电子显微镜解析的人源NMDA受体亚型GluN1-2B与单克隆抗体Fab片段007-168复合物的三维结构数据(分辨率为4.05 Å),属于结构生物学领域的蛋白质结构模态,主要用于研究抗NMDA受体自身免疫性脑炎的抗体-受体相互作用机制,为疾病机理探索和潜在治疗策略提供分子层面的结构依据。

Protein Data Bank Japan
2025-06-04 更新
浏览 21
MEMBRANE PROTEIN/IMMUNE SYSTEM
Human GluN1-2B with Fab 007-168

基本信息

创建/更新时间
2025-06-04

资源简介

人源GluN1-2B与Fab 007-168复合物结构

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Human GluN1-2B with Fab 007-168》。

【数据内容】

源站原始描述:Channel, heterotetramer, receptor, antibody, MEMBRANE PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.1038/s41594-024-01386-4。

【主题与分类】

主题标签:MEMBRANE PROTEIN/IMMUNE SYSTEM。

【获取与许可】

源站页面:https://www.rcsb.org/structure/8VUU

规范引用:Structural and functional mechanisms of anti-NMDAR autoimmune encephalitis. (2024) Nat.Struct.Mol.Biol

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源站:https://pdbj.org/mine/summary/8vuu

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个结构生物学数据集,包含人源NMDA受体亚型GluN1-2B与单克隆抗体Fab片段(007-168)复合物的高分辨率三维结构数据。数据来源于电子显微镜技术(分辨率为4.05 Å),由Michalski和Furukawa等研究人员于2024年提交至Protein Data Bank Japan(PDBj)。数据集主要应用于研究抗NMDA受体自身免疫性脑炎的分子机制,特别是抗体如何与受体结合并影响其功能,为理解疾病病理和开发靶向疗法提供结构基础。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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