ATRT影像与多组学整合数据集
ATRT诊断影像与甲基化再分析相关数据，用于研究ATRT亚型与解剖起源。由Institut Curie提供，来自GEO，包含多种数据模态，包含54条数据记录，适用于分类任务，专注于肿瘤领域的非典型畸胎样/横纹肌样瘤（ATRT）研究。
基本信息
资源简介
ATRT影像与多组学整合数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Imaging and multi-omics datasets converge to define different neural progenitor origins for ATRT-SHH subgroups [DNAmeth_EPICarray]》。源站首次发布：Aug 31 202。
【数据内容】
源站原始描述：Atypical teratoid rhabdoid tumors (ATRT) are divided into MYC, TYR and SHH subgroups, suggesting diverse lineages of origin. Here, we investigate the imaging of human ATRT at diagnosisand the precise anatomic origin of brain tumors in the Rosa26; Cre-ERT2::Smarcb1flox/flox model. This cross-species analysis points to an extra-cerebral origin for MYC tumors. Additionally, we clearly distinguish SHH ATRT emerging from the cerebellar anterior lobe (CAL) from those emerging from the basal ganglia (B…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Methylation profiling by genome tiling array、GPL21145、9606。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE242089
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 09 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE242089
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
ATRT诊断影像与甲基化再分析相关数据，用于研究ATRT亚型与解剖起源。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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