SMARCA4缺陷横纹肌样肿瘤甲基化数据集
包含SMARCA4缺陷横纹肌样肿瘤及相关甲基化数据，可用于ATRT相关分子比较分析。由Institut Curie提供，来自GEO，数据格式为表格，适用于分类任务，专注于肿瘤领域的非典型畸胎样/横纹肌样瘤（ATRT）研究。
基本信息
资源简介
SMARCA4缺陷横纹肌样肿瘤甲基化数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genome-wide DNA methylation profiling of SCCOHT and SMARCB1-mutated rhabdoid tumours》。源站首次发布：Jun 01 202。
【数据内容】
源站原始描述：Extracranial rhabdoid tumours (ECRT) are an aggressive malignancy of infancy and early childhood. The vast majority of cases demonstrate inactivation of SMARCB1 (ECRT_SMARCB1) but, rarely, ECRT can harbour the alternative inactivation of SMARCA4 (ECRT_SMARCA4) instead of SMARCB1. To explore the place of ECRTSMARCA4 in the "rhabdoid tumour" spectrum, we generated and collected from previous studies genome-wide DNA methylation array data (n = 85) from Atypical/Teratoid Rhabdoid Tumours (ATRT), ECR…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Methylation profiling by genome tiling array、GPL21145、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE175892
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 31 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE175892
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含SMARCA4缺陷横纹肌样肿瘤及相关甲基化数据，可用于ATRT相关分子比较分析。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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