乳腺癌进展早期失调数据集
该数据集包含正常乳腺组织、单纯导管增生、非典型导管增生和DCIS样本的表达谱,用于研究乳腺癌早期进展。由Boston University Medical Center提供,来自NCBI GEO,数据格式为表格,包含40条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的乳腺非典型增生研究。

基本信息
资源简介
乳腺癌进展早期失调数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Early Dysregulation of Cell Adhesion and Extracellular Matrix Pathways in Breast Cancer Progression》。源站首次发布:Jun 29 200。
【数据内容】
源站原始描述:Proliferative breast lesions, such as simple ductal hyperplasia (SH) and atypical ductal hyperplasia (ADH), are candidate precursors to ductal carcinoma in situ (DCIS) and invasive cancer. To better understand their relationship to more advanced disease, we used microdissection and DNA microarrays to profile the gene expression of patient-matched histologically normal (HN), ADH, and DCIS from 12 patients with ER+ sporadic breast cancer. SH were profiled from a subset of cases. We found 837 diffe…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL96、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE16873
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 23 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE16873
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 0.09 GB。
数据说明
该数据集包含正常乳腺组织、单纯导管增生、非典型导管增生和DCIS样本的表达谱,用于研究乳腺癌早期进展。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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