用于“在单细胞分辨率下探索人类参考图谱的功能组织单元”的已处理解剖图数据
主题标签：人类参考图谱、单细胞分辨率、功能组织单元、细胞类型注释、HRApop、解剖图、肿瘤、星形细胞瘤。本站分类：肿瘤/星形细胞瘤
基本信息
资源简介
用于“在单细胞分辨率下探索人类参考图谱的功能组织单元”的已处理解剖图数据
该数据集英文名为 Processed Anatomogram Data for "Exploring Functional Tissue Units of the Human Reference Atlas at Single-Cell Resolution"，由 Bueckle, Andreas、Herr II, Bruce、Bidanta, Supriya 与 Börner, Katy 共同完成，托管于 Zenodo，发布时间为 2026 年，采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可。数据集在本站被归类为肿瘤 / 星形细胞瘤，主题标签涵盖人类参考图谱、单细胞分辨率、功能组织单元、细胞类型注释、HRApop、解剖图、肿瘤与星形细胞瘤。其来源站为 doi.org，源站说明该数据是依据人类参考图谱细胞类型群体工作（HRApop）中的“下载数据、执行细胞类型注释并计算每个数据集的 CT 群体（DCTA）”工作流处理得到的。
【数据集背景】
该数据集面向人类参考图谱（Human Reference Atlas）相关研究，聚焦于在单细胞分辨率下探索功能组织单元。其处理流程来自人类参考图谱细胞类型群体工作（HRApop），该工作致力于对细胞类型群体进行系统化整理与计算。数据集在本站被归入肿瘤 / 星形细胞瘤分类，主题标签同时包含解剖图、细胞类型注释与单细胞分辨率等方向，说明其内容与组织解剖结构及细胞类型层面的注释分析密切相关。源站描述中提及相关工作流已发表于 Nature 旗下期刊 Scientific Data（文章编号 s41597-026-06642-4），可作为理解该数据集方法学背景的参考入口。
【数据内容】
数据集为经过处理的解剖图（Anatomogram）数据，处理过程包括下载数据、执行细胞类型注释，以及计算每个数据集的 CT 群体（DCTA）。其主题覆盖人类参考图谱、单细胞分辨率、功能组织单元、细胞类型注释、HRApop、解剖图、肿瘤与星形细胞瘤。除上述处理流程与主题标签所反映的内容外，源站未提供关于数据文件数量、格式、字段结构、样本规模或具体细胞类型列表的进一步说明。
【采集与来源】
数据来源站为 doi.org，托管机构为 Zenodo。源站描述指出，该数据是使用 HRApop 的“下载数据、执行细胞类型注释，并计算每个数据集的 CT 群体（DCTA）”工作流处理得到的。关于原始数据的采集地点、采集时间、样本来源与伦理审批信息，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签与处理流程，该数据集可服务于人类参考图谱构建、单细胞分辨率下的功能组织单元研究、细胞类型注释，以及按数据集计算 CT 群体的分析工作；其在本站被归类为肿瘤 / 星形细胞瘤，也提示其可能与该类肿瘤相关研究存在关联。除此之外的具体应用场景，源站未提供。
【使用方法】
源站描述仅说明该数据经由 HRApop 的“下载数据、执行细胞类型注释，并计算每个数据集的 CT 群体（DCTA）”工作流处理得到，并给出相关工作流的论文链接。关于数据的下载方式、目录组织、读取工具、依赖环境与复现步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集采用 Creative Commons Attribution 4.0 International 许可，发布于 2026 年，托管于 Zenodo。关于数据质量评估、误差范围、覆盖度、批次效应、样本代表性及已知使用限制，源站未提供。
【引用与许可】
使用该数据集时，应按照学术规范引用其作者 Bueckle, Andreas、Herr II, Bruce、Bidanta, Supriya 与 Börner, Katy，并注明数据集英文名 Processed Anatomogram Data for "Exploring Functional Tissue Units of the Human Reference Atlas at Single-Cell Resolution"、托管机构 Zenodo 与发布时间 2026 年。许可条款为 Creative Commons Attribution 4.0 International，允许在署名前提下使用与再分发。关于具体引用格式与 DOI 标识符，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23197082
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 2.6 MB。
数据说明
该数据通过人类参考图谱细胞类型群体项目（HRApop，参见 https://www.nature.com/articles/s41597-026-06642-4）的“下载数据、执行细胞类型注释并计算每个数据集的CT群体（DCTA）”工作流进行处理。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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