GSE302375：剪接保真度影响mRNA分子命运

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE302375

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

RNA剪接历来被认为高度高效且精确，很少偏离受调控的可变剪接决策。这一教条近来受到挑战，有观察提示生物学噪声可能对转录组多样性有实质性贡献。然而，对剪接中随机变异的定量理解颇具挑战，因为这些转录本很可能迅速降解。在此，我们利用跨RNA区室的超深度测序追踪人类细胞中的剪接中间体，发现与促进剪接噪声的基因组特征相关的大量隐秘剪接。我们观察到低保真剪接位点的广泛使用，可能源于剪接体招募或结合的随机性。这些位点最可能在细胞核内被降解，而非被依赖翻译的降解过程靶向，提示对非生产性RNA转录本存在广泛的监视和质量控制。我们的发现为RNA加工机制中错误倾向缓冲机制性噪声提供了前所未有的见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。