ACC基因表达谱数据集
该数据集为ACC(肾上腺皮质癌)的基因表达谱数据,来源于NCBI,包含58例固定石蜡包埋的ACC组织样本,采用定制基因表达分析
![GSE329772: Gene-expression profiling of ACC [1]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/145452.jpg)
基本信息
资源简介
ACC基因表达谱数据集
GSE329772 是一个聚焦肾上腺皮质癌(ACC)的基因表达谱数据集,标题为“Gene-expression profiling of ACC [1]”,来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),在本站归入肿瘤 / 肾上腺癌分类。该数据集基于定制基因表达分析,对 58 例固定石蜡包埋的 ACC 组织样本进行表达谱检测,并以压缩的系列矩阵文件形式提供下载。数据集由 Alexandra S. Triebig 提交,发布时间为 May 04 202,主题涉及表达谱芯片分析,并标注了平台编号 GPL36886 与物种编号 9606。整体而言,该数据集为肾上腺皮质癌的转录层面研究提供了一个以临床组织样本为基础的表达谱资源。
【数据集背景】
肾上腺皮质癌(ACC)是一种发生于肾上腺皮质的肿瘤,其分子层面的表达特征对于理解肿瘤生物学行为具有参考价值。该数据集以“ACC 的基因表达谱分析”为主题,针对这一肿瘤类型开展定制化的基因表达检测,属于表达谱芯片(Expression profiling by array)类数据,物种标注为 9606(即人类)。数据集的建立旨在通过对肿瘤组织样本的表达谱刻画,为相关研究提供可复用的表达数据基础。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE329772_series_matrix.txt.gz,即 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。该文件承载 58 例固定石蜡包埋(FFPE)ACC 组织样本的定制基因表达分析结果。系列矩阵是基因表达芯片数据常见的组织方式,通常以样本为列、探针或基因为行,汇总表达值及样本相关信息。数据集的主题标签包括 Expression profiling by array、GPL36886 与 9606,分别指向检测技术类型、芯片平台编号与物种来源。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),源站标题与数据集英文名一致,均为“Gene-expression profiling of ACC [1]”。源站描述说明该数据为对 58 例固定石蜡包埋 ACC 组织样本的定制基因表达分析。样本类型为固定石蜡包埋组织,这类样本是临床病理存档的常见形式。数据集作者为 Alexandra S. Triebig,发布时间为 May 04 202。除上述信息外,样本采集地点、伦理审批与具体临床信息等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肾上腺皮质癌基因表达层面的探索性分析,例如对 58 例 ACC 组织样本的表达谱进行整体特征描述、样本间表达模式比较,以及作为表达谱芯片数据用于方法学验证或与其他表达数据参照使用。由于其采用定制基因表达分析且样本为 FFPE 组织,也可用于考察该类样本在表达谱检测中的表现。具体研究用途应结合数据实际内容判断,源站未提供更细化的应用说明。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE329772_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段解析或编码差异导致批量处理出错。由于数据集仅提供 1 个系列矩阵文件,读取后需自行确认样本列与表达值行的组织方式,并结合平台编号 GPL36886 对应的注释信息理解探针或基因标识。源站未提供额外的使用脚本或分析流程。
【质量与限制】
数据集样本量为 58 例,全部为固定石蜡包埋的 ACC 组织样本,采用定制基因表达分析,文件数量为 1。FFPE 样本与定制分析平台可能对表达数据的特性产生影响,使用时应予以关注。数据集未提供临床随访、病理分级等配套信息,源站亦未提供质控指标或批次信息,相关质量评估需使用者自行开展。此外,发布时间标注为 May 04 202,年份信息不完整,引用时需留意。
【引用与许可】
数据集作者为 Alexandra S. Triebig,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,标题为“Gene-expression profiling of ACC [1]”。使用或引用时应注明该数据集名称与来源。关于许可条款、使用限制与正式引用格式,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE329772
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Custom gene expression analysis of 58 fixed-paraffin embeded ACC tissue samples
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