RNF5 相互作用组
该数据集来自 omicsdi.org，主题为 Proteomics，本站归类于肿瘤 / 急性髓系白血病。数据基于表达 Flag 标签 RNF5 或空载体的细胞，经蛋白酶体抑制剂 MG132 处理后制备裂解液，用 anti-Flag 抗体进行免疫共沉淀，洗脱产物经胰蛋白酶酶解并在 Q Exactive
基本信息
资源简介
RNF5 相互作用组
RNF5 interactome 是一个以蛋白质组学为主题的数据集，收录于 omicsdi.org，并在本站归类于肿瘤 / 急性髓系白血病方向。该数据集围绕 RNF5 的相互作用网络展开，实验体系基于表达 Flag 标签 RNF5 或空载体的细胞，在蛋白酶体抑制剂 MG132 处理以阻断蛋白质降解的条件下制备细胞裂解液，随后使用 anti-Flag 抗体进行免疫共沉淀，洗脱产物经胰蛋白酶酶解后在上 Q Exactive 质谱平台进行分析。整体来看，该数据集提供了在特定药物处理背景下，通过亲和纯化结合质谱鉴定 RNF5 相关蛋白的实验数据，可用于探索 RNF5 在急性髓系白血病等肿瘤背景下的潜在相互作用与功能线索。
【数据集背景】
RNF5 是一种被研究的蛋白质，本数据集以 Flag 标签 RNF5 表达细胞与空载体对照细胞为对象，结合蛋白酶体抑制剂 MG132 处理，目的在于富集并鉴定与 RNF5 相互作用的蛋白质。数据集被本站归类于肿瘤 / 急性髓系白血病，说明其应用背景与肿瘤、尤其是急性髓系白血病相关研究存在关联。源站描述未提供更多关于 RNF5 在急性髓系白血病中具体作用机制的信息。
【数据内容】
数据集的核心内容为免疫共沉淀联合质谱分析所产生的蛋白质组学数据。实验组为表达 Flag 标签 RNF5 的细胞，对照组为表达空载体的细胞。两组细胞均经过 MG132 处理以阻断蛋白质降解，之后制备细胞裂解液，并使用 anti-Flag 抗体进行免疫共沉淀。洗脱得到的产物经胰蛋白酶消化后，在 Q Exactive 质谱仪上进行分析。主题标签为 Proteomics。源站未提供具体的蛋白鉴定数量、肽段数量、定量结果或差异蛋白列表。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述，样本处理流程包括：细胞表达 Flag 标签 RNF5 或空载体，使用蛋白酶体抑制剂 MG132 孵育以阻断蛋白质降解，制备细胞裂解液，进行 anti-Flag 抗体免疫共沉淀，洗脱物经胰蛋白酶酶解，最后在 Q Exactive 上分析。源站未提供样本的具体细胞类型、培养条件、MG132 浓度与处理时间、免疫共沉淀缓冲液组成、质谱运行参数等详细信息。
【适用场景】
该数据集适用于蛋白质相互作用研究，尤其是针对 RNF5 的相互作用组分析。由于本站将其归类于肿瘤 / 急性髓系白血病，它可能用于与急性髓系白血病相关的蛋白质互作网络探索、候选互作蛋白筛选以及后续功能验证的线索挖掘。此外，该数据集也可用于蛋白质组学方法学参考，例如免疫共沉淀结合质谱鉴定互作蛋白的实验设计。源站未提供该数据集在特定疾病模型中的验证结果或临床相关性信息。
【使用方法】
使用者可依据源站提供的免疫共沉淀与质谱分析流程，理解该数据集的实验设计。典型使用方式包括：将 Flag-RNF5 组与空载体对照组进行比较，以识别可能与 RNF5 特异性结合的蛋白；结合 MG132 处理背景，关注蛋白酶体抑制条件下富集的相互作用。由于源站未提供原始数据文件、检索数据库、软件参数或统计分析方案，具体的数据处理与再分析步骤需参考源站记录。源站未提供数据下载格式、文件大小或访问链接等细节。
【质量与限制】
该数据集基于 anti-Flag 免疫共沉淀与 Q Exactive 质谱分析，实验设计包含空载体对照，有助于区分非特异性结合。MG132 处理可抑制蛋白酶体降解，可能影响互作蛋白的丰度与种类。源站未提供重复次数、阴性对照设置、非特异性结合过滤标准、质谱鉴定置信度阈值或定量方法等信息。因此，使用该数据集时需注意其覆盖范围与假阳性风险，具体质量评估指标源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息。如需引用或使用，请访问 omicsdi.org 上对应的数据集记录以获取最新信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000083160
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
表达Flag标签RNF5或空载体的细胞与蛋白酶体抑制剂MG132孵育以阻断蛋白质降解。随后制备细胞裂解物，用抗Flag抗体进行免疫沉淀，洗脱液经胰蛋白酶消化后在Q Exactive上进行分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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