Co-IP MS鉴定SETD1A结合蛋白
该数据集来自omicsdi.org，属于肿瘤/急性髓系白血病分类，主题标签为Proteomics和Multiomics。数据内容为对全长及截短型SETD1A免疫沉淀复合物进行gelLC MS分析，蛋白经异位表达，并以转导空载体的细胞中免疫沉淀的结合蛋白作为对照
基本信息
资源简介
Co-IP MS鉴定SETD1A结合蛋白
该数据集英文名为 Identification SETD1A-binding proteins by Co-IP MS，来源于 omicsdi.org，在站内归入肿瘤 / 急性髓系白血病分类，主题标签为 Proteomics 与 Multiomics。其核心内容是通过 gelLC MS 技术，对全长及截短型 SETD1A 的免疫沉淀复合物进行分析。实验中 SETD1A 蛋白经异位表达，同时以转导空载体的细胞中免疫沉淀得到的结合蛋白作为对照，用于识别与 SETD1A 相互作用的蛋白。整体来看，该数据集属于蛋白质组学与多组学交叉的免疫共沉淀质谱研究，聚焦于 SETD1A 结合蛋白的鉴定，可为急性髓系白血病相关分子机制研究提供蛋白质相互作用层面的数据支持。
【数据集背景】
SETD1A 是一种与基因表达调控相关的蛋白，在肿瘤尤其是急性髓系白血病的研究中受到关注。识别与 SETD1A 相互作用的结合蛋白，有助于理解其功能发挥的分子基础。该数据集正是围绕这一目标，采用免疫共沉淀结合质谱的策略，对 SETD1A 的相互作用组进行解析。数据集的分类归属为肿瘤 / 急性髓系白血病，说明其研究语境与该类恶性血液疾病的机制探索相关。主题标签 Proteomics 和 Multiomics 则表明，该数据兼具蛋白质组学与多组学整合研究的属性，适合在更广泛的组学框架下被参考和利用。
【数据内容】
数据集包含对免疫沉淀复合物进行 gelLC MS 分析所获得的结果。实验对象包括全长 SETD1A 和截短型 SETD1A 两类形式。蛋白通过异位表达方式引入细胞，随后对相应的免疫沉淀复合物进行质谱检测。为区分特异性结合蛋白与非特异性背景，研究还设置了对照：在转导空载体的细胞中同样进行免疫沉淀，并对其中的结合蛋白进行分析。因此，数据内容覆盖了全长 SETD1A、截短型 SETD1A 以及空载体对照三方面的质谱分析结果，可用于比较不同 SETD1A 形式所结合蛋白的差异。
【采集与来源】
该数据集来自 omicsdi.org。源站描述指出，数据集包含对全长和截短型 SETD1A 免疫沉淀复合物的 gelLC MS 分析，蛋白经异位表达，并以转导空载体的细胞中免疫沉淀的结合蛋白作为对照。除上述来源与实验策略信息外，关于具体样本来源、细胞类型、质谱平台型号、色谱条件、采集参数等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与 SETD1A 相互作用蛋白鉴定相关的研究场景。例如，在急性髓系白血病或更广泛的肿瘤分子机制研究中，可利用该数据筛选和比较全长 SETD1A 与截短型 SETD1A 的结合蛋白谱，进而提出关于 SETD1A 功能结构域或相互作用区域的假设。同时，由于主题标签涵盖 Proteomics 和 Multiomics，该数据也可作为多组学整合分析中的蛋白质互作证据来源，与其他组学数据联合使用，辅助构建分子调控网络。对于关注免疫共沉淀质谱方法在蛋白复合物研究中的应用者，该数据集亦可作为方法学参考案例。
【使用方法】
使用该数据集时，可围绕全长 SETD1A、截短型 SETD1A 与空载体对照三组结果进行比较分析。通常可将空载体对照用于识别非特异性背景结合蛋白，从而在 SETD1A 组中富集出更可能具有特异性的候选结合蛋白。进一步可对比全长与截短型 SETD1A 的结合蛋白差异，以推断截短区域对相互作用的影响。由于源站未提供具体的分析流程、阈值设定、统计方法及标准化步骤，实际分析时需依据数据文件自身格式与质量情况自行确定处理方案。
【质量与限制】
该数据集设有空载体对照，有助于降低非特异性结合带来的干扰，这是其设计上的优势。然而，关于样本重复数、质谱鉴定深度、定量准确性、假阳性控制策略、数据完整性及缺失值情况等质量相关指标，源站未提供。此外，数据集仅涉及 gelLC MS 分析层面的信息，是否包含原始谱图、峰列表或已鉴定蛋白列表等具体数据层级，源站未提供。因此，在未获得更多元数据的情况下，对该数据集的质量评估应保持谨慎。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、原始文献、作者信息、发表期刊、DOI 以及使用许可条款，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前，应另行核实其来源页面所附的许可与引用要求。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000080012
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含对全长及截短型SETD1A免疫沉淀复合物进行的凝胶LC-MS分析。蛋白质经异位表达，并以转导空载体的细胞中免疫沉淀的结合蛋白作为对照进行分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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