Pin1抑制剂ATRA与Pin1敲低的表达数据
该数据集来自NCBI GEO(GSE63059),包含通过荧光偏振高通量筛选鉴定Pin1抑制剂ATRA后,利用芯片表达谱在全基因组水平比较ATRA处理与Pin1敲低相似性的表达数据

基本信息
资源简介
Pin1抑制剂ATRA与Pin1敲低的表达数据
GSE63059 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达谱数据集,主题为 Pin1 抑制剂 ATRA 处理与 Pin1 敲低条件下的表达数据。该数据集所属分类为肿瘤 / 急性髓系白血病,源站标题为“Expression data from Pin1 inhibitor ATRA and Pin1 knockdown”。根据源站描述,研究者通过基于荧光偏振的高通量筛选将 ATRA 鉴定为 Pin1 抑制剂,并利用芯片表达谱在全基因组水平上展示 ATRA 处理与 Pin1 敲低之间的相似性。数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE63059_series_matrix.txt.gz,作者为 Shuo,Wei,发布时间为 Nov 06 201,主题标签涉及表达谱芯片、GPL17586 平台以及物种编号 9606。
【数据集背景】
该数据集围绕 Pin1 抑制剂研究展开。源站描述指出,ATRA 是通过基于荧光偏振的高通量筛选被鉴定为 Pin1 抑制剂的。为了在全基因组水平上说明 ATRA 处理与 Pin1 敲低之间的相似性,研究者开展了芯片表达谱分析。数据集所属分类为肿瘤 / 急性髓系白血病,主题标签中包含表达谱芯片、GPL17586 平台和物种编号 9606,表明其面向芯片表达谱研究场景。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件,样例文件为 GSE63059_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包格式,内容为系列矩阵文件。主题标签显示其属于 Expression profiling by array,涉及 GPL17586 平台与物种编号 9606。源站未提供样本数量、分组细节、基因数量或具体表达矩阵字段的进一步说明。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,数据集英文名为 GSE63059: Expression data from Pin1 inhibitor ATRA and Pin1 knockdown,源站标题为“Expression data from Pin1 inhibitor ATRA and Pin1 knockdown”。作者为 Shuo,Wei,发布时间为 Nov 06 201。源站描述说明,ATRA 经荧光偏振高通量筛选被鉴定为 Pin1 抑制剂,随后通过芯片表达谱在全基因组水平比较 ATRA 处理与 Pin1 敲低的相似性。其余采集平台细节、实验条件与样本处理信息源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于围绕 Pin1 抑制剂机制、ATRA 处理效应以及 Pin1 敲低表达谱相似性开展的分析场景,也可用于芯片表达谱数据的读取、字段核对与批量接入等通用数据处理任务。由于分类标注为肿瘤 / 急性髓系白血病,相关研究可在该主题范围内参考使用。具体分析设计是否适用,需结合源站未提供的样本与分组信息进一步确认。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE63059_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。源站未提供更详细的读取参数、预处理步骤或分析流程说明。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件,源站未提供样本数量、重复设置、质控指标或批次信息,无法据此评估数据质量。发布时间标注为 Nov 06 201,年份信息不完整。除源站描述外,源站未提供平台注释、归一化方法及缺失值处理等细节,使用时需自行核对文件内容。
【引用与许可】
作者为 Shuo,Wei,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站未提供引用格式、许可条款或使用限制的说明。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE63059
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
通过基于荧光偏振的高通量筛选,ATRA被鉴定为Pin1抑制剂。我们进行了微阵列表达谱分析,以在全基因组水平上证明ATRA与Pin1 KD之间的相似性。
数据缺失?
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