AstraZeneca内部细胞系表达数据

该数据集为AstraZeneca内部细胞系的基因表达数据,来源于NCBI的GEO数据库,编号GSE57083,采用表达谱芯片技术,平台为GPL570,物种为人(9606)

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL5709606
GSE57083: Expression data from AstraZeneca internal cell lines

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

AstraZeneca内部细胞系表达数据

GSE57083 是一个来自 AstraZeneca 内部细胞系的基因表达数据集,收录于 NCBI 的 GEO 数据库,编号为 GSE57083。该数据集采用表达谱芯片技术,平台为 GPL570,物种为人(9606),本站将其归类于肿瘤 / 急性髓系白血病方向。数据集由 Mark Wappett 提交,发布时间为 Apr 25 201。源站将其描述为“Full legacy gene expression dataset run internally”,即一份在内部完成的完整遗留基因表达数据集。数据集仅包含一个文件,文件样例为 GSE57083_series_matrix.txt.gz,适合用于基因表达谱相关的分析与研究。

【数据集背景】

该数据集来源于 AstraZeneca 内部细胞系的基因表达检测,属于肿瘤研究领域,本站分类将其归入急性髓系白血病方向。源站标题为“Expression data from AstraZeneca internal cell lines”,表明其数据产生于企业内部细胞系研究场景。数据集由 Mark Wappett 提交至 NCBI 的 GEO 数据库,编号 GSE57083,发布时间为 Apr 25 201。源站描述称其为“Full legacy gene expression dataset run internally”,说明这是一份在内部运行完成的完整遗留基因表达数据集。该数据集采用表达谱芯片技术,平台为 GPL570,物种为人(9606),主题标签包括 Expression profiling by array、GPL570 和 9606。

【数据内容】

该数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE57083_series_matrix.txt.gz。文件以 GZIP 压缩包形式提供,内容为基因表达谱数据。数据集采用表达谱芯片技术,平台为 GPL570,物种为人(9606)。源站描述将其概括为“Full legacy gene expression dataset run internally”。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、基因数量、具体细胞系名称、实验条件或表达值分布等更详细的数据内容说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI 的 GEO 数据库,编号 GSE57083。数据由 Mark Wappett 提交,发布时间为 Apr 25 201。源站标题为“Expression data from AstraZeneca internal cell lines”,源站描述为“Full legacy gene expression dataset run internally”。数据集采用表达谱芯片技术,平台为 GPL570,物种为人(9606)。主题标签包括 Expression profiling by array、GPL570 和 9606。除上述信息外,源站未提供关于样本采集流程、实验设计、细胞系来源或处理方法的更多细节。

【适用场景】

该数据集适用于基因表达谱相关的分析场景,尤其是基于表达谱芯片技术的研究。由于本站分类将其归入肿瘤 / 急性髓系白血病方向,且来源为 AstraZeneca 内部细胞系,该数据集可用于肿瘤细胞系表达特征的研究。平台为 GPL570,物种为人(9606),适合与同一平台或同一物种的其他表达谱数据进行比较分析。主题标签中的 Expression profiling by array 表明其属于芯片表达谱研究范畴。除上述信息外,源站未提供关于具体适用场景、分析目标或研究问题的更多说明。

【使用方法】

使用该数据集时,可下载数据文件 GSE57083_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包格式,需按相应格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。数据集仅包含一个文件,文件样例即为 GSE57083_series_matrix.txt.gz。除上述信息外,源站未提供关于数据预处理、标准化方法、分析流程或软件工具的具体说明。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI 的 GEO 数据库,编号 GSE57083,由 Mark Wappett 提交,发布时间为 Apr 25 201。源站描述称其为“Full legacy gene expression dataset run internally”。数据集仅包含一个文件,文件样例为 GSE57083_series_matrix.txt.gz。除上述信息外,源站未提供关于数据质量评估、缺失值情况、批次效应、技术重复或验证结果的具体说明。由于源站未提供样本数量、实验条件等细节,使用者在分析时需自行评估数据的适用性与局限性。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Mark Wappett,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,编号 GSE57083,发布时间为 Apr 25 201。源站标题为“Expression data from AstraZeneca internal cell lines”。除上述信息外,源站未提供关于引用格式、许可条款、使用限制或版权归属的具体说明。使用者在引用或使用该数据集时,应参考 NCBI GEO 数据库的相关规定,并自行确认许可与使用条件。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE57083

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Full legacy gene expression dataset run internally

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