DNA甲基化随机性与转录变异性相关并识别遗传定义AML亚型间的趋同表观遗传破坏

资源简介

DNA甲基化随机性与转录变异性相关并识别遗传定义AML亚型间的趋同表观遗传破坏

GSE319461 是 NCBI GEO 上的一个 SuperSeries，标题为“DNA methylation stochasticity is linked to transcriptional variability and identifies convergent epigenetic disruption across genetically-defined subtypes of AML”，即“DNA 甲基化随机性与转录变异性相关联，并识别出遗传定义急性髓系白血病（AML）亚型间趋同的表观遗传破坏”。该数据集归入肿瘤 / 急性髓系白血病分类，由 Andrew P. Feinberg 提交，发布时间为 Feb 12 202（源站标注如此）。数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE319461_series_matrix.txt.gz，主题标签涉及高通量测序表达谱分析、平台 GPL20301 与物种编号 9606。整体上，该数据集围绕 AML 中 DNA 甲基化随机性与转录变异性的关系展开，并指向不同遗传亚型之间趋同的表观遗传异常。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI GEO，标题明确指向急性髓系白血病（AML）研究。其核心科学关注点是 DNA 甲基化随机性与转录变异性之间的关联，以及在不同遗传定义的 AML 亚型中识别趋同的表观遗传破坏。数据集被组织为 SuperSeries，源站描述说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成，表明其结构上是对若干子系列的综合汇总。主题标签中的高通量测序表达谱分析与平台 GPL20301 提示数据涉及表达谱层面的测序检测，物种编号 9606 对应人类。

【数据内容】

数据集当前列出的文件数量为 1，文件样例为 GSE319461_series_matrix.txt.gz，属于 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。该文件通常承载系列层面的样本与特征信息，可用于了解该 SuperSeries 的组织方式与样本注释。源站描述仅说明该 SuperSeries 由所列 SubSeries 组成，未提供各 SubSeries 的具体名称、样本数量、分组设计或检测指标等细节。数据主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL20301 与 9606，分别对应高通量测序表达谱分析、GEO 平台编号与人类物种编号。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即 NCBI GEO 数据库。数据集作者为 Andrew P. Feinberg，发布时间标注为 Feb 12 202。源站描述指出该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成，但未提供具体子系列清单、样本采集地点、伦理审批信息或实验流程细节。平台信息以 GPL20301 标注，物种为人类（9606）。除上述来源与作者信息外，采集方法、样本来源与处理流程在源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于关注急性髓系白血病表观遗传学的研究场景，特别是探讨 DNA 甲基化随机性与转录变异性之间关系的分析，以及比较不同遗传定义 AML 亚型之间表观遗传破坏趋同性的研究。主题标签表明其涉及高通量测序表达谱分析，因此可用于表达谱层面的数据探索与整合分析。由于该数据集为 SuperSeries，也适合作为汇总入口，用于定位其下属子系列所承载的具体数据资源。具体分析类型与适用范围应结合源站子系列信息进一步确认，源站未提供更细化的适用说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE319461_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩包格式，需按对应格式解压后读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入后续分析流程。由于该数据集为 SuperSeries，实际分析时还需结合其下属 SubSeries 的数据文件与注释信息。源站未提供具体的读取脚本、参数设置或分析流程说明。

【质量与限制】

当前可确认的信息包括：数据集为 NCBI GEO 上的 SuperSeries，包含 1 个系列矩阵文件，作者为 Andrew P. Feinberg，发布时间标注为 Feb 12 202，主题标签涉及高通量测序表达谱分析、平台 GPL20301 与人类物种编号 9606。限制在于：源站描述仅说明该 SuperSeries 由所列 SubSeries 组成，未提供子系列清单、样本量、数据质控指标、批次信息或缺失值情况；文件数量仅为 1，具体数据覆盖范围需以实际文件内容为准。发布时间标注为“Feb 12 202”，年份信息不完整，源站未提供更明确的日期说明。

【引用与许可】

源站未提供引用格式与许可条款信息。使用该数据集时，应遵循 NCBI GEO 的通用使用规范，并参考源站页面获取最新说明。作者信息可标注为 Andrew P. Feinberg，数据集标识为 GSE319461。源站未提供具体的许可类型、使用限制或致谢要求。