FL-Fc-DM1药物对THP-1细胞基因表达的影响
该数据集来自NCBI GEO,研究FL-Fc-DM1药物对急性髓系白血病模型THP-1细胞基因表达的影响。数据包含经不同浓度FL-Fc-DM1处理的THP-1细胞总mRNA的高通量测序表达谱,共1个文件

基本信息
资源简介
FL-Fc-DM1药物对THP-1细胞基因表达的影响
GSE300849 数据集来自 NCBI GEO,研究 FL-Fc-DM1 药物对急性髓系白血病模型 THP-1 细胞基因表达的影响。该数据集以 THP-1 细胞作为急性髓系白血病(AML)研究模型,对经不同浓度 FL-Fc-DM1 处理后的细胞总 mRNA 进行高通量测序,获得表达谱数据。数据集归类于肿瘤/急性髓系白血病方向,包含 1 个数据文件,即 GSE300849_series_matrix.txt.gz,属于表达谱高通量测序数据,物种为人(9606),平台为 GPL16791。整体而言,该数据集为在细胞水平上考察 FL-Fc-DM1 对 AML 细胞转录组影响提供了直接的测序数据基础。
【数据集背景】
该数据集的研究背景围绕急性髓系白血病的治疗探索展开。根据源站描述,为消除细胞周期阻滞的 AML 细胞,研究者开发了 FL-Fc-DM1 药物,其构建方式是将 FLT3 配体 Fc 融合蛋白与美登素(mertansine)偶联。研究中选用 THP-1 细胞作为 AML 模型,用以评估该药物对细胞基因表达的影响。数据集标题即为“Effect of FL-Fc-DM1 drug on gene expression of THP-1 cells”,直接点明了研究对象与处理因素。
【数据内容】
数据集包含经不同浓度 FL-Fc-DM1 处理的 THP-1 细胞总 mRNA 的高通量测序表达谱。数据以表达谱(Expression profiling by high throughput sequencing)形式组织,物种为人,平台编号为 GPL16791。数据集仅包含 1 个文件,文件样例为 GSE300849_series_matrix.txt.gz,即系列矩阵文件,通常用于汇总样本层面的表达信息。源站未提供样本数量、具体浓度梯度设置、分组细节及基因层面的注释信息。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),源站标题与数据集英文名一致。作者为 Dengyang zhang,发布时间为 Jun 25 202(源站所载年份信息不完整,按原样记录)。数据集主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL16791 与 9606。源站未提供具体的实验操作流程、测序平台仪器型号、建库方法及生物信息学处理流程等细节。
【适用场景】
该数据集适用于考察 FL-Fc-DM1 药物处理对 THP-1 细胞转录组表达谱的影响,可用于 AML 细胞在药物干预下基因表达变化的探索性分析。由于数据涵盖不同药物浓度处理后的总 mRNA 测序结果,可用于比较不同浓度条件下的表达差异模式。具体可支持的统计比较设计与分析目标需结合样本分组信息确定,源站未提供相关分组说明。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE300849_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。源站未提供该文件的具体字段说明与预处理建议。
【质量与限制】
数据集仅含 1 个文件,样本规模、重复设置与浓度梯度信息源站未提供,因而难以从现有信息判断统计效力与组间可比性。数据为高通量测序表达谱,源站未提供质控指标、归一化方法及批次信息。发布时间的年份信息不完整,引用时需注意核对。使用前应自行核查数据完整性与适用性。
【引用与许可】
引用该数据集时应注明来源为 NCBI GEO,数据集编号 GSE300849,作者为 Dengyang zhang。源站未提供具体的许可条款与使用限制说明,使用与再分发前应向源站确认相关要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE300849
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为消除细胞周期阻滞的急性髓系白血病(AML)细胞,我们通过将FLT3配体Fc融合蛋白与美登素偶联,开发了一种FL-Fc-DM1药物。我们使用THP-1细胞作为AML模型。对不同浓度FL-Fc-DM1处理的THP-1细胞的总mRNA进行了测序。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




