小鼠MLL-AF9白血病细胞Sgf29 CRISPR敲除的RNA-seq与ChIP-seq
该数据集来自小鼠MLL-AF9白血病细胞，通过CRISPR技术敲除Sgf29基因，并开展RNA-seq与TST-ChIP-seq实验
基本信息
资源简介
小鼠MLL-AF9白血病细胞Sgf29 CRISPR敲除的RNA-seq与ChIP-seq
RNA-seq and ChIP-seq in mouse MLL-AF9 leukmemia cells with CRISPR knockout of Sgf29
该数据集来自小鼠MLL-AF9白血病细胞，通过CRISPR技术敲除Sgf29基因，并开展RNA-seq与TST-ChIP-seq实验。RNA-seq用于获取基因表达谱，ChIP-seq用于检测SGF29在染色质上的靶向结合情况。数据可用于研究Sgf29敲除对MLL-AF9细胞基因表达和染色质定位的影响，帮助理解该基因在急性髓系白血病中的功能。数据集包含1个文件，即GSE223665_series_matrix.txt.gz，由Chun-Wei Chen于2023年1月25日发布（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jan 25 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：该数据集考察了小鼠MLL-AF9细胞中Sgf29敲除的影响。报告了基因表达谱（RNA-seq）和SGF29的染色质靶向（TST-ChIP-seq）。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL24247、10090。本站分类：肿瘤/急性髓系白血病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE223665
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 05 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE223665
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集研究了小鼠MLL-AF9细胞中Sgf29基因敲除的影响。报告了基因表达谱（RNA-seq）和SGF29的染色质定位（TST-ChIP-seq）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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