外周血小RNA文库深度测序分析microRNA转录组
该数据集来自NCBI,标题为外周血小RNA文库深度测序分析microRNA转录组,本站归类为肿瘤/急性髓系白血病。可用于研究外周血microRNA表达谱,探索急性髓系白血病相关转录组特征,支持表达谱分析与生物标志物挖掘(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
外周血小RNA文库深度测序分析microRNA转录组
GSE19833 是一项以外周血小 RNA 文库深度测序为基础、分析 microRNA 转录组的数据集,源站标题为“Analysis of microRNA transcriptome by deep sequencing of small RNA libraries of peripheral blood”,来自 NCBI。该数据集在本站归类于肿瘤 / 急性髓系白血病方向,可用于研究外周血 microRNA 表达谱,探索急性髓系白血病相关转录组特征,并支持表达谱分析与生物标志物挖掘。数据集由 Alok、Bhattacharya 提交,发布时间为 Jan 11 201,包含 1 个文件,样例文件为 GSE19833_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集围绕外周血小 RNA 深度测序所获得的 microRNA 转录组信息展开,适合作为表达谱层面研究的参考资源。
【数据集背景】
该数据集的主题为通过深度测序外周血小 RNA 文库来分析 microRNA 转录组。源站描述指出,该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,说明其在组织方式上属于一个汇总性条目。本站将其归入肿瘤 / 急性髓系白血病分类,提示该数据与急性髓系白血病这一疾病方向存在关联,可用于围绕外周血 microRNA 表达特征开展研究。数据集作者为 Alok、Bhattacharya,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,发布时间为 Jan 11 201。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE19833_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩包格式。主题标签包括 Expression profiling by array、GPL6244 和 9606。结合标题与分类信息,数据内容主要涉及外周血小 RNA 文库深度测序所得的 microRNA 转录组表达信息,可用于表达谱层面的查看与分析。源站未提供关于样本数量、测序深度、具体 microRNA 条目数量等更细粒度的内容说明。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI,源站标题为“Analysis of microRNA transcriptome by deep sequencing of small RNA libraries of peripheral blood”。从标题可知,其采集对象为外周血小 RNA 文库,技术路线为深度测序,分析目标为 microRNA 转录组。源站描述仅说明该 SuperSeries 由所列 SubSeries 组成,未提供采样人群、采集地点、时间跨度等更详细的采集信息。
【适用场景】
该数据集可用于研究外周血 microRNA 表达谱,探索急性髓系白血病相关转录组特征,支持表达谱分析与生物标志物挖掘。由于主题标签涉及表达谱分析平台信息,也可作为表达谱数据读取、字段核对与预处理流程的实践素材。具体到疾病分组比较、差异表达分析或标志物验证等研究设计,源站未提供可直接支撑的说明。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE19833_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。对于表达谱矩阵类文件,通常需要关注行与列所代表的特征和样本信息,但该数据集的具体字段结构源站未提供,需以实际文件内容为准。
【质量与限制】
该数据集仅有 1 个文件,整体规模较为有限;源站描述较为简略,未提供样本量、测序质量、归一化方法、批次信息等质量相关细节。本站分类为肿瘤 / 急性髓系白血病,但源站未提供疾病分组、临床注释或验证结果等信息。因此,在使用时应以文件实际内容为准,并在小样本核对阶段确认字段与编码的可靠性。源站未提供更完整的质量评估结论。
【引用与许可】
数据集作者为 Alok、Bhattacharya,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,发布时间为 Jan 11 201。引用时应注明数据集名称 GSE19833 及其源站标题。关于许可条款、使用限制与再分发条件,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE19833
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.
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