FEV缺陷的MV4-11细胞转录组图谱
该数据集为GSE166621，来源于NCBI，包含FEV缺陷的急性髓系白血病细胞系MV4-11的转录组表达谱。通过shRNA敲低FEV表达，并以非沉默对照比较，利用Illumina HiSeq 2500进行高通量RNA测序，分析两组间的差异表达基因
基本信息
资源简介
FEV缺陷的MV4-11细胞转录组图谱
Transcriptome profile of MV4-11 cells with FEV deficiency
该数据集为GSE166621，来源于NCBI，包含FEV缺陷的急性髓系白血病细胞系MV4-11的转录组表达谱。通过shRNA敲低FEV表达，并以非沉默对照比较，利用Illumina HiSeq 2500进行高通量RNA测序，分析两组间的差异表达基因。数据可用于研究FEV在AML细胞归巢和增殖中的调控机制，以及筛选相关下游靶基因（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Feb 11 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：增强的归巢和不受控制的扩增是AML细胞的特征。我们鉴定了一个转录因子FEV（第五Ewing变异）作为调节因子。为了评估调控机制，使用shRNA在AML细胞系MV4-11细胞中敲低FEV表达。转导了非沉默对照（NC）和FEV shRNA（shFEV）的MV4-11细胞培养3天并通过FACS分选。收集细胞，并根据制造商方案使用Trizol试剂盒（Takara Bio，Otsu，Japan）分离总RNA。高通量RNA测序（RNA-seq）由Illumina HiSeq 2500（Illumina，San Diego，CA）在CapitalBio Corporation（Beijing，China）进行。分析了两组之间的差异表达基因。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL24676、9606。本站分类：肿瘤/急性髓系白血病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE166621
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 03 202，引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
增强的归巢能力和不受控制的增殖是AML细胞的特征。我们鉴定了一个转录因子FEV（第五Ewing变异体）作为调控因子。为评估其调控机制，我们使用shRNA在AML细胞系MV4-11细胞中敲低了FEV表达。将转导了非沉默对照（NC）和FEV shRNA（shFEV）的MV4-11细胞培养3天，并通过FACS分选。收集细胞，按照制造商说明书使用Trizol试剂盒（Takara Bio，日本大津）提取总RNA。高通量RNA测序（RNA-seq）由CapitalBio公司（中国北京）使用Illumina HiSeq 2500（Illumina，美国加利福尼亚州圣迭戈）完成。分析了两组之间的差异表达基因。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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