人类细胞全局供体与受体剪接位点动力学
该数据集来自 NCBI,标题为人类细胞全局供体与受体剪接位点动力学,属于肿瘤/急性髓系白血病分类,包含 1 个文件(GSE129635_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及高通量测序表达谱、GPL20301 与 9606

基本信息
资源简介
人类细胞全局供体与受体剪接位点动力学
GSE129635 是一个来自 NCBI 的基因表达数据集,英文标题为 Global donor and acceptor splicing site kinetics in human cells,中文可译为“人类细胞全局供体与受体剪接位点动力学”。该数据集在本站归入肿瘤 / 急性髓系白血病分类,主题标签涉及高通量测序表达谱、GPL20301 平台与物种编号 9606。数据集共包含 1 个文件,样例文件名为 GSE129635_series_matrix.txt.gz,作者为 Leonhard、Wachutka,发布时间为 Apr 11 201。整体来看,该数据集围绕人类细胞中 RNA 剪接位点的动力学特征展开,适合作为研究剪接调控与相关疾病机制的参考数据。
【数据集背景】
该数据集源站标题为 Global donor and acceptor splicing site kinetics in human cells,关注人类细胞中供体与受体剪接位点的全局动力学。源站描述指出,瞬时转录组测序与动力学建模可用于提示 RNA 剪接的动力学与产率如何编码于人类基因组之中。这一背景说明数据集的核心主题是 RNA 剪接过程的时间特征与产量特征,而非单纯的静态表达水平比较。本站将其归入肿瘤 / 急性髓系白血病分类,表明该数据在站内被组织到肿瘤相关主题之下,可供相关研究方向参考使用。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE129635_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式。主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL20301 与 9606,分别对应高通量测序表达谱、芯片/测序平台编号以及人类物种编号。源站描述强调瞬时转录组测序与动力学建模,说明数据内容与 RNA 剪接动力学相关。除上述文件与标签信息外,源站未提供更细的字段结构、样本数量或具体测量指标说明。
【采集与来源】
该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI。作者信息为 Leonhard、Wachutka,发布时间为 Apr 11 201。源站描述提到瞬时转录组测序与动力学建模,可作为理解数据采集方式的线索。除此之外,源站未提供采样组织、细胞类型、实验批次或测序深度的具体说明。
【适用场景】
基于其主题与分类,该数据集可用于关注人类细胞 RNA 剪接位点动力学的研究场景,也可作为肿瘤 / 急性髓系白血病相关主题下的表达谱参考数据。主题标签中的高通量测序表达谱提示其适用于转录组层面的分析。由于源站描述涉及动力学建模,该数据也可能用于剪接动力学与产率相关的方法学参考。具体适用分析类型源站未提供。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE129635_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。由于数据集仅包含 1 个文件,读取流程相对集中,但仍应注意压缩包解压后的矩阵结构。更详细的读取参数与字段含义源站未提供。
【质量与限制】
该数据集文件数量为 1,样例文件为 series matrix 格式,适合作为汇总矩阵使用。受限于源站未提供样本量、测序深度、重复数或质控指标,无法对数据质量作进一步评估。本站分类为肿瘤 / 急性髓系白血病,但源站描述未明确说明样本与疾病的对应关系,使用时需谨慎解读分类标签。其他质量相关信息源站未提供。
【引用与许可】
作者为 Leonhard、Wachutka,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。引用时应参考源站标题 Global donor and acceptor splicing site kinetics in human cells 及数据集编号 GSE129635。许可信息源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE129635
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
瞬态转录组测序与动力学建模揭示了RNA剪接的动力学和产率如何在人类基因组中编码。
数据缺失?
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