ENA数据集WEHI样本

该数据集来源于 omicsdi.org,收录了急性髓系白血病(AML)病例在接受 BCL2 抑制剂治疗后的外显子组测序分子图谱数据,属于肿瘤与急性髓系白血病分类下的 Genomics 主题样本

omicsdi
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基因组分类Genomics
ena-DATASET-WEHI-30-03-2021-00:44:27:049-462 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

ENA数据集WEHI样本

ena-DATASET-WEHI-30-03-2021-00:44:27:049-462 - samples 是一个收录于 omicsdi.org 的肿瘤相关数据集,归属于急性髓系白血病(AML)方向,主题标签为 Genomics。该数据集围绕一例急性髓系白血病病例在接受 BCL2 抑制剂治疗后的分子图谱展开,核心手段为外显子组测序,用于呈现治疗背景下肿瘤样本的分子层面特征。从分类上看,它同时涉及肿瘤学与血液系统恶性肿瘤中的急性髓系白血病,属于以基因组学为主要视角的样本级数据资源。整体而言,该数据集强调“治疗后”这一特定时间节点,并通过外显子组测序的方式获取分子信息,为关注 BCL2 抑制剂治疗与 AML 分子变化之间关系的研究者提供了一个可参考的数据对象。

【数据集背景】

该数据集来源于 omicsdi.org,分类归属于肿瘤 / 急性髓系白血病。其源站描述指出,该数据是对一例急性髓系白血病病例在接受 BCL2 抑制剂治疗后所进行的分子图谱分析,具体通过外显子组测序完成。急性髓系白血病是一种血液系统恶性肿瘤,而 BCL2 抑制剂属于靶向治疗范畴,因此该数据集所处的背景是靶向治疗与血液肿瘤分子特征研究的交叉领域。主题标签为 Genomics,说明其组织与呈现方式以基因组学为核心。关于该病例的更详细临床背景、治疗周期、用药方案细节以及研究机构等信息,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的核心内容是针对一例 AML 病例在接受 BCL2 抑制剂治疗后所获得的外显子组测序分子图谱。外显子组测序通常用于捕获蛋白编码区域的遗传变异信息,因此该数据集在内容层面应涉及与编码区相关的分子变异图谱。数据集名称中包含“samples”字样,表明其以样本为组织单位进行收录。主题标签为 Genomics,进一步说明其数据内容围绕基因组学展开。关于具体样本数量、测序深度、覆盖度、变异位点数目、突变谱细节、是否包含配对样本或纵向时间点等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org,数据集英文名称为 ena-DATASET-WEHI-30-03-2021-00:44:27:049-462 - samples。从名称结构看,其与 ENA 相关的数据集命名方式存在关联,但关于原始样本采集地点、采集时间、处理流程、测序平台、建库方法、伦理审批信息以及具体提交机构等,源站未提供。可以确认的是,该数据集通过 omicsdi.org 这一来源站进行收录与索引,并归属于肿瘤 / 急性髓系白血病分类之下。

【适用场景】

基于其分类与主题标签,该数据集适用于与急性髓系白血病分子特征相关的研究场景,尤其是关注 BCL2 抑制剂治疗后外显子组层面变化的方向。潜在使用场景包括:作为 AML 靶向治疗后分子图谱的参考样本;用于基因组学主题下的数据整合与比较分析;用于探索外显子组测序在血液肿瘤治疗监测中的应用价值。此外,由于该数据集归属于肿瘤分类,也可在肿瘤基因组学的广义框架下被引用或二次分析。关于具体分析工具、推荐流程或特定研究问题的适配性,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以样本形式组织,主题标签为 Genomics,使用者可依据 omicsdi.org 来源站的相关入口获取数据。关于数据下载方式、文件格式、访问权限、是否需要注册、是否提供 API 或批量获取途径、配套元数据字段说明以及推荐的分析流程等,源站未提供。因此,具体使用方法需以来源站的实际说明为准。

【质量与限制】

该数据集仅涉及一例 AML 病例,样本规模有限,这是其潜在的限制之一。其源站描述聚焦于 BCL2 抑制剂治疗后的外显子组测序分子图谱,未提供关于数据完整性、测序质量指标、变异验证情况、批次效应或重复性等信息。关于数据是否存在缺失、是否经过质控、是否包含对照样本以及结果的可推广性等,源站未提供。使用者应结合自身研究目的谨慎评估其适用性。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、是否允许商业用途以及是否需要联系原作者或提交者等,源站未提供。建议使用者在使用前查阅 omicsdi.org 来源站的相关说明,以确认合规的引用与使用方式。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001007307

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Molecular profiling by exome sequencing of an AML case following treatment with a BCL2 inhibitor

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