基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-08

资源简介

WEHI-AML 外显子组测序样本数据集

ena-DATASET-WEHI-17-08-2017-10:28:08:992-407 - samples 是一个面向肿瘤领域、聚焦急性髓系白血病（AML）的外显子组测序样本数据集，收录于 omicsdi.org 来源站，主题标签为 Genomics。该数据集围绕 WEHI-AML-1 与 WEHI-AML-2 两个样本开展外显子测序，采用 Human All Exon v5_UTR Capture Library 与 Agilent Technologies SureSelectXT2 Target Enrichment System 完成外显子捕获，并在 Illumina HiSeq2500 平台上完成测序。整体而言，该数据可用于急性髓系白血病相关的外显子组变异分析、基因组学研究及肿瘤分子机制探索，为白血病分子层面的研究提供测序样本资源。

【数据集背景】

急性髓系白血病是一种起源于髓系造血细胞的恶性克隆性疾病，其发生发展常伴随多种基因突变与基因组结构异常。随着高通量测序技术的成熟，外显子组测序成为识别蛋白编码区变异、探索肿瘤驱动事件的重要手段。该数据集正是在这一研究背景下产生，定位于肿瘤/急性髓系白血病方向，以 WEHI-AML-1 和 WEHI-AML-2 为研究对象，通过外显子捕获与测序获取编码区序列信息，服务于白血病相关的基因组学研究。其主题标签为 Genomics，表明数据核心属于基因组学范畴。

【数据内容】

该数据集为样本层面的外显子组测序数据，涉及 WEHI-AML-1 与 WEHI-AML-2 两个样本。数据内容围绕这两个样本的外显子区域序列展开，可用于后续的变异检测、基因组学分析及肿瘤分子机制探索。数据集名称中包含 “samples” 字样，提示其以样本为组织单位。除上述样本信息与测序类型外，源站未提供更细粒度的数据内容说明，例如具体文件格式、数据量、变异位点数量等。

【采集与来源】

数据来源站为 omicsdi.org。根据源站描述，该数据通过外显子测序获得，外显子捕获使用 Human All Exon v5_UTR Capture Library，并结合 Agilent Technologies SureSelectXT2 Target Enrichment System 完成目标区域富集，测序在 Illumina HiSeq2500 平台上进行。研究对象为 WEHI-AML-1 和 WEHI-AML-2。上述信息构成了该数据集在采集平台、捕获试剂与测序仪器方面的主要来源依据。除此之外，源站未提供样本采集地点、时间、伦理审批等更多来源细节。

【适用场景】

基于其外显子组测序属性与急性髓系白血病分类，该数据集适用于急性髓系白血病相关的外显子组变异分析、基因组学研究以及肿瘤分子机制探索。研究人员可将其用于识别编码区变异、比较样本间的基因组差异，或作为白血病分子机制研究的测序数据资源。其 Genomics 主题标签也表明，该数据可服务于更广泛的基因组学分析场景。需要说明的是，源站未提供针对特定分析流程或特定疾病亚型的适用性验证信息。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明，包括数据下载方式、预处理步骤、比对与变异检出流程、参考基因组版本等。使用者如需使用该数据，应依据来源站 omicsdi.org 的相关指引获取数据，并结合外显子组测序的通用分析流程进行处理。由于源站未提供详细的操作说明，具体使用方式需以实际获取的数据与来源站信息为准。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估信息，例如测序深度、覆盖度、碱基质量、重复率等指标，也未提供数据限制说明。该数据集仅涉及 WEHI-AML-1 与 WEHI-AML-2 两个样本，样本数量有限，源站未说明其是否具有群体代表性。使用者应结合来源站提供的信息自行评估数据质量与适用性。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用者在使用该数据时，应查阅来源站 omicsdi.org 的相关页面，以获取可能的引用要求与许可条款。

原始链接

https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001003570

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001003570

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对WEHI-AML-1和WEHI-AML-2进行外显子组测序。外显子捕获采用Human All Exon v5_UTR捕获文库和Agilent Technologies SureSelectXT2目标富集系统，并在Illumina HiSeq2500平台上进行测序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别